申告しても大丈夫です。
できるだけ配慮してくれます。
ただ二サークルしかない場合はどうなるかわかりません

｢イベント｣で具体的な被害をうけた(設営がこちらにはみ出してくるとか、嫌がらせを受けたであるとか)であれば多少配慮される場合もありますが、トピ主さんの理由では無理だと思います。何千ものサークルの要望を全て聞いていたらキリがないので、実害が大きい場合しか対応は難しいのではないかと……
サークル数が少なければ隣接する可能性は高いと思います。
同カプで他に仲の良い方がいたら合体参加をお願いしてみてはどうでしょうか？少なくとも片方の隣は確定しますし、合体参加している相手がいればその方とばかり会話していても不自然ではないので。

配慮されます。友人が実際運営に毎回申し立てをして配慮して貰っています。しかし2サークルの場合どうなるかは不明です。