何も知らない人から見たら悪く映りかねないとありますが、悪く映ったって角が立ったっていいんじゃないかと思います。
それなりに凹むこともあるかもしれませんが、当事者でもない他人が何も知らないのに「トピ主さんがブロ解したらしい」と聞きかじっただけで「トピ主さんが悪い！」と安直に思い込むとしたら
そんな情報の取捨選択するような人によく思われる価値ってありますか？
仲良しの相互さんに一言「周りにどう思われるかという不安よりも、相手と繋がってる苦痛の方が勝る。心配してくれてありがとう。」と言えば本当にトピ主さんを思ってくれる相互さんであれば理解してくれますよ。
ブロ解したところで、低浮上になったところで、問題の相手にどのくらいダメージがあるかは分かりませんが、精神衛生保つために切れる縁は切る事もいいと思います。

万人仲良くは難しいです…。ご自身第一で動いたほうが吉かと思います。
いくら筋が通ってたってそれは正義ではないです。

支部でもツイッターでも双方ともにブロック、相談に乗ってくれた相互さんには「創作すら出来なくなりそうだから、ちゃんと区切りをつけたい」と話してみる、それで騒ぐ外野はあなたの味方になるわけじゃないから「同類かぁ…」と思って距離を置く。シャットダウン出来る機能があって使えるのなら、そういうときのものですから利用してもいいと思います。

DMに関してはお気に入りマークを付けるようにして、その人のものが目に入らないようにしておくぐらいですかね…開くときに見ちゃうけど。

私も前、あれこれ難癖つけられて「何様だよーー！！」ってなって創作で答えたことがあります。しかし、その代わりエネルギー切れを起こしてしまいました…。
やり返す、のはあまりお勧めしません。多分あの行為は悪魔に魂を売っています、根こそぎ精神力を奪われてます。自分以外の守るものがあるときはいいかもしれないけど、そうじゃないときは歯止めが効かなくなって力加減が出来なくなります。

なんか大変ですね。取り合えず事柄を全て分けて整理してはどうでしょうか？
と思ったけど、整理しておきました。

「先方」・自分の作品に自分勝手にアドバイスをしてくる・私以外の人とも問題を起こしてブロ解される方
→先方にあなたは、ブロ解はせずにそっと距離を置いた。→結果しばらく平和になった。

「最近起きた問題」支部の方に批判メッセージが来た。内容は誹謗中傷ではなく筋の通った主張
→同人歴が長い友人が出てきた経緯が良く分からなかった…。→取り合えず批判が来た。

「今あなたが思う事と行いたい事」
・悔しい気持ちでいっぱい、やり返したい
・先方をブロ解したい
・なんにせよスッキリしたい。
・作品レベルを上げて相手を黙らせたい
・罪悪感を相手に沸き立たせたい
・今は自分の気分が荒んでいるから冷静になりたい。

「仲良しの相互さん」・何も知らない人から見たら私も悪く映り兼ねない、損するようなことをして欲しくない。
→これを言われたあなたは、ブロ解すると仲良しの相互さんの言葉を無視したと思われないか心配になったと、

という感じでしょうか、思ったより問題が沢山あるな…。
　取り合えず先方とピクシブに批判を送った人は別で考えてはどうでしょうか？たとえ九分九厘同じと思ってもです。別の人と思えば相手への仕返し(極端な言い方ですが)は2回です。

・ここから私の意見になります。
　まず「あなたが思う事と行いたい事が多いので三つくらいに減らしましょう」自分が仮に三つにするなら・やり返す・先方をブロ解する・作品のレベルを上げるかな…。

１、一番簡単な「先方について」ブロ解する、簡単な理由で、自分と他の人に問題行動を取っている。
　→あなたの友達は周囲に悪く思われないか心配と言っています。相手が周囲に迷惑行動を取っていたなら、別の相互にちょっかい出してたのを見たからあれは我慢するべきではないと言えます。この事について友達に何か言うのは心理学的にトピ主様がマイナスになるため言わずに、普通に接するのが最善だと思います。友達に聞かれたら上記のように言えばよいかと。
2、ピクシブのDMこれは消せないとの事ですが、私なら報告かブロックします。匿名で来てるんですよ、これほど通報やブロックがしやすい相手はいないでしょう、その相手がツイッターで騒いだらそれこそ自滅・滑稽ですよね。
3，作品のレベルを上げる、についてはツイッター(作品展示場所)を良くすると私なら考えます。ヘッダーや自己紹介を綺麗に描き直し、作品の品質を安定させ、浅く広い交流(絵の感想や朝挨拶してる人へ全員返す等)をする。展示場所が良いと即座に作品価値が上がるし、長期的(技術面でも良い情報を得られる)にも上がります。また、先方と類友のような相互の精査も出来るので私はこちらを一番重視します。(他の二つは一瞬でできるので)

これを同時に行えば、むしろ周囲の評価を上げつつ、仕返しが出来ます。
…さて、私がメッチャやり返すような文章を書いた事で、多分トピ主様はこちらを読んで「うわ、なんかすごい事書かれてる」って思って冷静になってくれたのではないかな…。冷静になれ～

支部のブロックをお勧めします。
他の人からはよく分からないものなので、交流関係を気にする必要はありません。
的外れな批判ではないから、と遠慮しているかもしれませんが、創作意欲に関わるから見たくないというのも大事な理由です。例えばタグ付けがおかしかったという場合、正しい適切なタグを付けるかそれを指摘すればいいだけですが、そういった類のものではないのですよね？余計な言葉があったのかなと思います。そういったものを避けるのは、環境整備であり、真っ当な批判からの逃げとは違います。

ツイッターの方は、仲良しさんの心配はわかりますが、既に色々な人から避けられ始めている問題の相手と繋がりを持ち続けているのも、周囲から見たらどうなんでしょうね……。平穏をとるのも勿論ありですけど、変な人とずっと繋がっている人は、フォローしにくいので、更に周囲が問題人物を避けるようになったら、思い切ってブロックした方がいいとは思いますが。