iPadのみで漫画同人誌をつくっています。
クリスタのタブ一覧にあるところは主要な印刷所ばかりですし、基本的には原稿がちゃんとしていればどこの印刷所でも問題ないかと思います。逆にiPadで入稿できないところは、私は今のところ聞いたことがありません(あったらすみません...)。
ただ原稿データをアップロードする時にiPadもしくはスマホ入稿の場合、正しくアップロードできていない事があるのでよく確認して下さいという注意書きは見たことがあります。