注文受け付けました、と配送しましただけ送っています。それがないとお金に関わることなので不安になると思うので。事務手続きは丁寧にしますが、お手紙とかは一切入れないです。

手紙は自由だけど、「本日発送しました」くらいの発送メッセージはお願いします。
届かない場合主さんが発送を怠ったのか事故なのか分かりません…。

発送通知の際にメッセージ送れますよね？
それだけは送っています。

発送通知は、自分内での目印も兼ねて送ってましたね。この人はもう発送済み、この人はまだ…という。

何もしないのは、印象悪くなりやすいかなーって思います。ネット通販で買い物すると、受付メール→発送通知メールぐらいは最低あるじゃないですか。
企業の通販とは違うと言う人もいると思うんですけど、手順そのものはネット通販と同じなので。

BOOTHですよね。
購入の経験上、発送通知だけの場合が多いです。boostをした時はお手紙が入っていることがありますが、無くても気になりません。お手紙やおまけ目当てのBOOSTではないので。
売り手側のとしては、発送通知する時にお礼と発送の旨をお伝えします。BOOTHのシステム上、発送通知ボタンを押さないと取引完了にならないので、そのついでにコピペの文面を送っています。
なお、購入時に自動でメッセージを送れる機能もあったと思いますが、使ってません。