pixiv、Twitter、オフ同人……同人の形は色々ありますが、全て需要は違うと思います。
Twitterはコミュニケーションが主なSNSなので、瞬間で面白かったりすぐに理解できるものが受けます。Twitterをメインにして十万字の小説をあげたり50Pの漫画を上げる人は中々いないと思います(もちろんゼロではないですが)。

一方、pixivはストーリーものの漫画だったり数万字ある小説が受けます。pixivも一応SNSではありますが、コミュニケーションを主としたTwitterに比べて「作品閲覧サイト」としての趣が強く、腰を据えて二次創作を読む人が多いからだと思います。オフ同人はここから更に作品としての重量が求められるイメージです。

なので、Twitterで評価されるよりpixivで評価される方がいいとか、またはその逆とかは一概には言えないと思います。
トピ主さんがサクッと読めてサクッと萌える作品を目指しているなら、Twitterの評価の方が参考になるかもしれません。そうではなく、長くても余韻があったりいろいろ考えさせる作品を目指しているならpixivの方が参考になるかもしれません。

また、ジャンルによるかもしれませんが、正直数ブクマの差はあまり気にしない方がいいと思います。周りが100で自分だけ10とか、周りが数千で自分だけ100とかならハッキリとした違いがあるのだと思いますが、そうでないなら固定読者の違いだと思います。

Twitterとpixivの数、違うことよくあります。
だいたいTwitterでいいねして下さった方はpixivでブクマなどしませんし、pixivでブクマつけてくださる方はTwitterにいなかったりします。
Twitterでいいねしたからpixivまではいいかなって方が多いだけなのか、単にTwitterのほうが反応しやすいだけだったのかはわかりませんが(Twitterにpixivのリンク貼ると、その呟きはいいねするけどブクマはしないとか)
両方つける方は本当にその関連作品は全部食べたいんだろうなって印象があります。
どういう心理かはわかりませんが自分でもすることはあるので、まぁそんなものなんだろうな…と思ってます。
言ってしまえばTwitterもpixivもどちらも参考にはできませんしならないと思います、でもTwitterとpixivの数の間かTwitterの数の3分の2くらいで考えたら良いんじゃないかな…と個人的には感じます。