二次創作の電子版は、女性向けだと袋叩きにされますが、男性向けではさほど大事にはなりません。
理由は色々ありますが割愛します。
飽くまで自分ならどうするか、ですが…

紙本は1500円ということなので、電子版は同じ1500円か、少し安めにして1200～1300円にします。
電子版の値段を同じ1500円にする場合は、後から「要望があったので、電子版でも頒布します」とイベント後日に頒布開始します。
電子版を少し安めの価格帯にする場合は、事前に「少しお得な電子版も発行予定です」とイベント当日か翌日に電子版を出します。

一番無難というか、炎上やらのリスクを抑えつ方法は、紙の本が完売した後に電子版を発行することです。
これであれば「電子で出しやがって」という人でも黙ることが多いです。
「完売しちゃって、かといって増刷することも出来ないから電子版を出した」という名目があるからです。

とは言え、男性向けは二次創作の電子版でも割りと寛容というか、炎上することはそこまで多くないので気にしすぎない方が良いです。
ただ「紙と同時」を考えると色々天秤されるものが増えるので、私はいつも「完売後に電子版」としています。

そう言ってる私も、なんだかんだ電子版で出すリスクは考慮しているので
電子版を出してるジャンルは公式ガイドラインで「電子書籍OK」となっているジャンルでのみ出しています。
トピ主さんも、少しでも不安に感じているなら電子版は出さず、
遠方でイベント行けない勢には「通販」で対応などが無難かと思います。

男性向けなら電子で出しても女性向けみたいな酷い文句こないと思います。
紙の本の在庫管理に悩んでらっしゃるなら完売後に電子で売り出すとか方法はありますよ。
その場合、紙の本頒布スタート時に読者の方へ完売後は電子頒布しますってアナウンスしとくのも手です。
無断転載とか考えたらそういう対策をきちんととってくれる売り場、DLSITEで売るのがいいと思います。男性向け二次創作を買うお客もあそこは多いですし。販売データの対応種類もJPGやPDFなどいろいろ豊富です。
成人向けだと修正作業が出てきますが、すでに紙の本向けの修正作業が済んでるなら、電子版登録時にDLSITEへ作業をお任せすることができます。
要はDLSITEの修正基準であちらがモザイクかけたり黒海苔を増やしてくれるって事です。
（参加者の方々には電子版で黒海苔やモザイクが多くなるかもといったアナウンスは別途必要になりますが）
まあ、サークル登録時にマイナンバー求められるのがちょっとめんどくさいですけど、何も対策が取られてないBOOTHで売るよりいいと思います。