強いて言えば一次のが得意です。
二次だと描きたいシチュエーションを思いついても「このキャラはこんなことしない」という壁にぶつかって描けないことがしばしばあります。
それと一次の方が流行り・王道のシチュや展開を素直に取り込めます。二次だと自分の願望や大衆の需要をそのまま反映させるのに抵抗感があるんですよね。できる限り原作らしさを維持したい気持ちがあります。カプにしてる時点で〜とか言われがちですが、自分は0か1かではなく程度問題だと思っているので。
一方で一次だとキャラもストーリーも全部自分の所有物なので、ウケ狙うのも自分の願望モロ出しにするのも自由！何してもOK！って感じで気楽にやれます。

一次の方が得意です。制限がないのが大きい。
二次創作も楽しいんですが、どうしても原作という縛りがある都合上、その範囲内でやれる事には限界があるので。

あと、人のキャラをお借りして創作する性質上、過度にキャラクターの人格から離れた行動、特に倫理観のない行動を強制することには、強い抵抗があります。
原作で罪を犯してないキャラクターに犯罪をさせるのとか。
原作で見られない一面を妄想できるのが二次創作の醍醐味ですが、キャラクターをお借りしているという意識が常にあるので、私はそういう犯罪系は苦手でやれないです。
あと味方ネームドキャラの当て馬とか、原作で悪役ではないキャラにヘイトを向けさせる展開も出来ないです。
原作で悪役なら、原作で描写されているヘイトを使って展開を練ることは出来るんですが…。
一次創作だったら抵抗なくガンガンやれることが、二次創作だと出来ません。二次創作では原作の世界観を第一に尊重するので…。
その制限の中で、いかに創作するか。それを考えるのが楽しくもあるんですけどね。

逆に一次創作だったら自分が作ったキャラクターなので、倫理観の欠如した展開を盛り込みまくるし、キャラクターがどうなろうと知ったこっちゃないので、やりたい放題やってます。