逆に一次から二次に移動しました。
一次の頃はこういうキャラを作りたいじゃなくて、こういうシーンを形にしたい、こういう話を書きたいというシチュ優先で創作してました。
異世界転生ものが書きたい、転生先で主人公がちやほやされて転生先のイケメンといい感じになるけど、最後は元の世界に帰っていくビタエンが書きたい、という感じです。
書きたい話ありきでキャラを作るので、ぶっちゃけキャラクターを作るというより、話を動かすための舞台装置を作る感覚でした。
キャラ優先でやりたいなら、完全一次よりも企画系うちよそ創作の方がやりやすいかもしれませんね。

企画系うちよそ創作は、世界観は主催の方が決めていて、その世界に沿ったオリキャラを作成、企画の趣旨に合わせつつ、他の方が作成したキャラをお借りして創作するものです。各々のオリキャラを動かすこと以外、やってる事は二次創作に近いです。
いきなり世界観、キャラクター、ストーリーまで全て自力で作成して、しかもそれを完結させるのってかなり大変です。大体途中で放置して終わります。
こういううちよそ交流系でオリキャラ作成と動かすことに慣れてから、完全な一次創作に挑戦した方がスムーズに作れるかもしれません。

二次創作をしている時、これもうキャラを借りたオリジナルでは？と公式に対する罪悪感で苦しくなることが増えた為、気兼ねなく創作したいなーと一次創作に移りました。無理に自カプはこれと決めてから話を作ろうとすると解釈違いで自分の首を締める為、萌えるシチュに辿り着くために都合の良い登場人物を錬成、召喚させる方法を採用しています。例えばもうすぐバレンタインだなぁ→受けからチョコを貰った時、攻めがどんな反応すると萌えるかな→嬉しくて動揺しまくったら可愛いかも→じゃあ普段はクールな攻めにするか→どうして動揺しんだろう→絶対チョコを渡さなそうな受けに貰ったとか？→お堅いリーマンは絶対くれなそうかも→じゃあ今回はリーマンものにするか〜…クール×生真面目ね…すれ違いありそう…！みたいな感じで妄想を膨らませるのです。その頃にはなんと無くキャラデザも浮かんでます。

権利関係とか気になってしまうの分かります、私は現在も二次創作も並行して続けてますが、権利関係が気になる気持ちを押さえつけるのに疲れてしまった時に動かす用の一次創作キャラがいます。避難、息抜きみたいな感じです。
がっつりストーリー組んで長編漫画描く感じじゃなく、ほとんどは楽しい妄想で終わり、稀に描くのは描きたいシーンだけ描いたり、みたいな感じでやってます。
なのでトピ主さんがガッツリやりたい場合は合わないかもしれません。あとBLじゃなくて百合なのでそこももしかしたら差異があるかもしれません。
それでもよければ。

私の場合、二次創作していて性癖と解釈違いや倫理的な問題の間で苦しんだことをとっかかりにしました。
例えば私がビiッiチ受けが好きだとします。
ある程度好きになるキャラやカプの傾向はあったので、とあるジャンルでも性行為に慣れていそうなキャラが受けのカプにハマりました。
でも描いていくうちに、確かに性行為に慣れていそうではあるけど、ビiッiチってほどではないんじゃないか…このキャラだと自分の好きなシチュエーションが描きにくい…と感じることが何度かありました。
また、倫理的な問題（と言えばいいのか分からないですが）もありました。不特定多数とするなんて病気にかかりそうで心配になってしまう、とか、一日中性行為にばかりかまけているのはちょっと人としてどうなんだ…とか。
なので、二次創作は解釈と倫理優先で楽しみつつ、並行して上記の問題を解決する一次創作キャラを作ろうと思い立ちました。
そして生まれたのがサキュバス受けです。
どれだけビiッiチでも解釈違いなんて怒らないし、人外なので病気もない、そういう種族なんだから一日中性行為にかまけていても問題ない！
あとはどんな攻めなら萌えるかな〜と考えて、自分は正反対のカプが好きなので、性に奔放な受けの真逆で、性的なことに潔癖で全然抱いてくれない攻めにしよう！　という感じでメインカプ２人が出揃いました。
あとは、どうやって二人は知り合うのか？　どうして攻めが性的なことに潔癖なのか？（過去の設定）　どうして受けは抱いてくれない攻めに固執するのか？　何がきっかけで相手に惹かれ始めるのか？　初夜はどんな感じか？　と疑問を重ねていってエピソードを固めていきました。
出会いから付き合うまでの妄想が固まったら、あとはその過程や、付き合った後に起こりそうだな〜起こったら萌えるな〜と思う小ネタを妄想して、たまに作品にしたりしてます。

何かの役に立てば幸いです。

自カプの二次創作ネタを考えてたときにポッと浮かんだネタが、面白いのに自カプだと微妙に解釈違いだな……となり、じゃあせっかくだしオリジナルでやればいいじゃん！と思いついたのがきっかけですね。
ネタ考えるときはシチュエーション先行なので、一次で描いてるカプは二次創作してるカプと全然方向性が違います。
関係性としては依存し合うような仄暗いカプが好きなんですが、思いつくシチュがギャグやアホエロばかりなので一次では暗さなど微塵も感じない明るいカプばっかり描いてます。でも楽しいです。

トピ主さんは「少ない公式設定をかき集めて盛って関係性を作る」とあるので、一次に向いてるんじゃないでしょうか。発想の種さえあれば肉付けは自分でできるということですし。キャラクター、シチュエーション、舞台設定など、何かしら「こういうの面白そう」という発想の土台さえできればみるみるうちに作品になるんじゃないでしょうか。