配慮する対象が自分以外の誰かなら、トピ主さんのおっしゃる方法でよろしいと存じますよ。

トピ主さんがあげている逆カプの方の方法は、人数の多いCPやジャンルで他人への配慮は置いておいて、自分がTwitterを快適に使えるようにしている工夫ですね。
自カプ内でもフォロワーだけなど見る人を自分が厳選したいから検索避けをする、そのカプが苦手な人のTLにミュートをすり抜けて表示されたり、別に好きでもないカプへの下げツイートが他人に見られる事は、自分のTLの快適さには関係ないからどうでもいいって人居ます。

自カプと次推しの他カプ(逆ではない)を呟いたら他カプで検索してきたオタクの空リプで文句つけられたことがあり、以来自カプ以外は全部検索避けしてます。他カプの方への配慮というか変な人からの自衛のためって感じです。
自カプ逆カプのどちらか/どちらも避けるのはどちらが一般的かというのは答えが出ない気がしますが、検索避けする/しないと決めて行動してる人たちの思惑を想像してもあんまり意味ないかもしれないかなとちょっと思いました。
ネットでは全然違う倫理とか指針とか信念で発言する人たくさんすれ違うので。