そもそも根本的に創作とは自分の中から出てくるもので構成されているので、愛を主題として描くなら「自分がどういうものを愛だと認識してるか」という自我からは絶対に逃れられない。
そういう意味ではあらゆる創作に作者の自我は投影されているし、自己投影されていない創作なんてものは存在しないです。
二次創作でよく批判的な文脈で言われる自己投影というのは、主に作者本人（のものと思われる）願望や性質を安易に肯定するための都合のいい展開や、そのために原作で描かれているキャラクター性を曲げることだと思います。
例えば原作では溌剌として人間関係にも積極的な受けがうじうじ後ろ向きな受け身キャラになっていて、その上で複数の男性キャラや所謂スパダリに大幅改変された攻めから特に理由なく溺愛されるとか。
この場合、恋愛に受け身で陰キャなのは女オタクの多数に共通する要素かつ不特定多数の異性やスパダリからのモテが女性の願望として分かりやすすぎるので安易に感じてしまう。何をキャラの願望とするかの部分でちゃんとキャラ固有の事情を掘り下げて解釈されていれば自然にストーリーも深くなり、都合の良さも薄れるのではないかと。
ただし女オタク作者が共感しやすいキャラや関係性に改変された作品は当然読み手の女オタクからも共感しやすく需要も確かにあるので、二次創作としては否定されるものでもないと思います。
トピ主さんの自分の食べやすい方向に解釈が向かうというのは作者としての感性であり作風なので、そこは否定せず大事にするべきかと。

全然トピズレだけど捏造BLじゃなくて公式BL作品で活動した方がよさそう
3回くらい公式BLカプジャンルROMってるんだけど、まさにこの関係性が好き！自己投影上等！受けは私！攻めも私！カ〜〜〜ッ気持ちわかるわ〜〜〜！！みたいな、どこもそんな感じだった
作風だと思うので、無理に変えないで羽伸ばせるカプいったら良さそう
どこにトピ主の安住の地あるかわからんけど、頑張って公式BLでそこそこ二次創作オタクいるカプで思う存分感情移入できるストーリーかこ
あとは、自己投影キショいみたいなの日本のオタクだけで別に日本以外は好きに自己投影しまくっていい空気なので日本人少ない海外ジャンルで自己投影しまくる手もある
外国人オタクのマジのありえんくらいの自己投影って気合い入り過ぎだから、日本人の考える自己投影なんか可愛いもんだよ

突き詰めたらただのお人形遊びなので自分の好みから価値観まで自分がどうしても入るのは仕方なくないか
カリオストロだって原作者もルパンっぽくないっていうほど原作らしくないはやおの投影入ってるだろうし
都合のいいストーリーにならないように逆張りして描いてみたらいいんじゃない
今まで培ってきたキャラの考察や自分の作ったストーリーを具体的に批判して見てみるとか
幅広い人や狙った層が自己投影がしやすい、共感できるってつまり王道ってことでしょ？シンプルに王道の逆を行ってみるとしたらキャラの心情や行動はどんなふうに変わるんだろうって考えて見たりとか
大体自分の経験を通して他人を見るのが人間だから、たとえAIに客観的に分析してもらってもその中でも自分が共感できる部分を強調して描いてしまう生き物なんだよ

自己投影自体は否定されるものではないこと、創作と切り離せないことを理解しました。
都合が良い感じを消すために、心理描写や行動原理の整合性についてはしつこいほど詰めました。言い訳がましいくらいです。原作での描写を全部通すための理論が割とシンプルな子だったので、見せたいものに言い訳を付けるためにまどろっこしい湾曲した理論をつけている、といった印象もそこまでありません。

ただ、私がそのテーマを書きたい!と意志を持って選んだ訳では無いにしろ、結果的に自分の根幹というか、自我に割とガッツリ接触してくるテーマになってしまっているので、自己投影が悪!みたいな価値観を抜きにしても世に出すことに抵抗を感じている状態です。
私が誰にもカミングアウトしていないトランスジェンダーで、たまたまトランスジェンダーのキャラに惹かれたとするのが分かりやすいでしょうか。そのキャラを語るにあたってトランス要素に触れないのはむしろ変で主軸に添えることになんら違和感はないのだが、あまりにも自分に密接に関わる内容すぎて世に出すのが怖い…といった感じです。

創作なんて結局のところ全部自我なので、薄味のテンプレBLで適当にお茶を濁しでもしない限り、というか真面目に作れば作るほど、自分の価値観に密接に関与してくるようになると思います。
であれば、創作をする以上自己開示の勇気を持つ必要があると思うのですが、どうやって乗り越えていますか??

私の好みのキャラの姿だけど私自身の考えや反応とは違うので自己投影とか自己開示とか思ってないな…
自己投影臭いと感じるのは自分の好みじゃない解釈されてる時だと思う
人は自分の好みや自分のキャラの理想像を作ると「キャラはこうあるべき。原作キャラはこうなんだ」って無意識に思い込むんじゃないかな
そして他人の作品の自分好みじゃない部分を見て「自分が好みで解釈したのと同じくその書き手はも自分の好みに従ってこんな解釈した」とはならず「こんなのが好きな人なんているはずがないから自己投影」と判断した時「自己投影キモい」という感情が出てくるんじゃないかな

人が自分の好みとのギャップに自己投影を感じるなら、書き手が自分の好みを明確に出せば出すほど自己投影臭さを感じさせる可能性があると思う
だから三人称でキャラ解釈論文か？っていうぐらいキャラの言動や心理についてその理由や由来を描写したり
実況してるのか？ってぐらいくどい心理描写を入れた一人称とか
読み手にもそれぞれ解釈があるのにそれを尊重しないで自分の解釈をこれでもかと叩きつければ拒絶反応（自己投影キモい）は出るのはなんか分かる気がする
自己投影と言われたくないならキャラ解釈しっかりやるのはいいけど、それを作品に全部吐き出して私の解釈！！！！って読み手に押し付けないで、読み手の想像にある程度委ねるようにすれば違いが明確じゃないから拒絶反応出ないかも