自分もありました。しかも一人ではなく複数だったのでツイッターの暗黙のルールなのかと悩みましたが、相手が地雷カプ好きだったのでどうでもよくなりました。

作品は好きだけどツイッターのプレイスタイルは合わないのでフォローしないとか、交流するつもりはないけど絵は好きとか、そういう理由じゃないでしょうか。
リストインしてフォローしたつもりでいるとかもあります。
人によってはフォロバされたくなくてフォローしない人もいるんじゃないでしょうか。
私はあまり横繋がりの交流を増やしたくなくて、同ジャンルの人はあまりフォローしないことはありますが、RTで回ってきたものやリスインで見てるものをいいねすることはよくあります。

自分は現ジャンルで好きなキャラと苦手なキャラがいて、苦手キャラの話題が多い方は興味深い話題をツイートされる方でもフォローはせずに気が向いた時に直接見に行ったりはします。(予期せずTLに現れるよりは自分で見に行く方が気が楽なので)

あとは、あまりしがらみなく気楽にツイッターをしたいという方には、フォローを使わずに非公開リストでツイートを見ている人もいるみたいです。(リスト入れたり外したりしても通知が行かないため)

引用ツイートでコメントされた場合は、引用でお返事を返しても失礼にはならないかなと思います。

私の場合ですが、過去に同カプ好きの方を相互フォローしても相手から外されたことが度々あったので、新たにフォローするのが慎重になっているのがあります。
それと、荒らしの被害にあったことがあり鍵垢になっているのでＦＦ外の同カプ好きの方に話しかけづらい状態になってます……。

皆さまご回答ありがとうございました！大変参考になりました。
様々なケースがあるようなので、もうしばらく様子を見て問題なさそうであれば少しずつこちらからも声をかけてみようかと思います。

リストで見れるならフォローしなくても良い、というのは分かる気がします。
なにかこだわりがあって「フォロー数を増やしたくない」とか、定点観測くらいのつもりでリストで見れれば それで良い、とか
なにかそういう理由があるんじゃないでしょうか。