アンソロ主催経験ありです。
トピ主様のアンソロジー作品に対しての認識は間違っていないと思います。私も同じ考えです。
ただ、参加者様が同人慣れしていなかったり、アンソロジーのルール付けが足りてないと、想像の範囲を超えたトラブルが起こってしまうイメージかあります。
今回の場合、告知段階で「既存作品NG」「新作オンリー」といったルール付けをしていなかったのなら、上記の提出作品に対して文句は言えないかなと思います。
もし告知サイトやSNSで「既存作品NG」と伝達済みでしたら、その旨をそのままお伝えして変更していただければ大丈夫かと。
私がアンソロ主催した際に、NG項目に触れている作品があったので、本当に申し訳ないのですが…と下から下からお願いして、NG項目に触れている部分だけ変更していただきました。
正直な話、その参加者様の作品がNG項目に触れていないのなら公開したとてトピ主様が責められるようなことにはならないと思いますし、webアンソロジーとのことで印刷費もかからないので、私だったらそのまま受け取っちゃいます。
モヤモヤはしますけどね😂