小説だと縦式がおすすめです。
iPhoneのメモ帳で大方を書いた後に縦式に流し込み、修正しています。
行や文字数の調節も簡単で、単語検索ができるので「この表現また使ってる……」ってなったときに検索かけて潰せるのが個人的に良いです！

漫画は、買い切りではないですが、本を作りたいのであればクリスタEXが圧倒的に便利です。
見開きにできたり、ページ順を変えたり、一括書き出しができたり……複数のページ管理に慣れると手放せません。
(Twitterの原稿進捗で見かける「原稿タワー」が作れるのはこのアプリのみかと)

無料だとアイビスやプロクリエイトが有名ではないでしょうか。
アイビスはクリスタにデータを持っていけるので、上記のことと合わせて製本したい時だけ月額でクリスタを入れる、というのもありかもしれません。

小説はNolaというアプリを使ってます。スマホアプリやブラウザと連動出来るので、出先でちょちょっと書き進めて家でじっくり続き、なんて風に。
「」を書くと中に自動でカーソルが行ったり、章ごとに書いて並び替え、プレビュー機能など便利です！無料会員でも十分使える印象。
アプリでは無いですが、ipadを立てかけられるケースやBluetoothのキーボードもお勧めです。

絵はアイビスを使ってますが、ipadで同人誌を描くなら初めからメディバンorクリスタで慣れてしまったほうが楽かもです。私は今クリスタに移行しようとしてるのですが、アイビス慣れしてしまって苦戦中です…。

良きipadライフを〜！