「相手に迷惑かけられない」と言ってる舌の根も乾かぬうちに「最悪落とせばいい」とも言えてしまってる時点でそりゃモチベ上がらないよ…
私が合同誌相手だったら熱が冷めてかけてるカプの原稿を無理やり描かれるのも迷惑だと思ってしまいます
大なり小なり迷惑はかかってしまうと思うので、まずはお相手に相談されてはどうでしょうか

いつか、AB熱もCD熱も落ち着いた頃(そして別ジャンルのカプにハマっているかもしれない頃)読み返した時に、頑張って描いて良かったなあと自分が思えるよう、なんとか作り上げます。
そして合同誌ですので、他の参加者さんたちにも「面白かったよ」と言ってもらえるくらいのレベルにはしたいなと発破をかけます。

現在進行形で新しくハマっているCDが熱い分、ABへの冷め方が引き立ってしまいますが、ゆくゆくはどちらのカプも自分の歴史になります。どちらのカプへの愛も、比べるものではなくそれぞれ独立したものだと思います。好き(だった)という感情に嘘はありませんから、踏ん張って頑張ってください！

最高のカプC×Dと言ってるのを見るとトピ主さんはひとつのCPを突き詰めて創作するタイプなのかな？と思いました（違ってたらすみません）
CDを優先したいという自覚もおありのようですし、それは仕方ないと思います。

ただ合同誌は本当に相手に迷惑掛からないように完成までこぎつけてください。あとは自由にすればいいと思います。
こういうトラブルって偶然でしかないというか、タイミングの問題で私も気持ちはよくわかりますが自分の問題をCDのせいにしてるようにも見えてしまうかもしれませんし、原稿頑張ってくださいとしか言えないです。

とにかく絵の練習、漫画演出の技術向上、己のアップデートと割り切る方向に舵切ってはどうでしょう
こうやったら読み手喜ぶだろうな的なのをスキルフルにやればまあそんな同人レベルで悪い本にはならないし
今回で向上したスキルは次のカプで活動するのに無駄にはならないと思います
やかましい、技術は十二分にあってひたすらやる気起こらんのじゃいとかならすみません…