厳しいこというようですけど、単に塗り方が下手だったり、塗り作業に慣れてないだけです。
ラフ線画はめっちゃ上手く描けるけど、ペン入れするとなんか微妙って人はペン入れが下手だし、
線画まではめっちゃ上手く描けるけど、塗ると微妙って人は塗りが下手ですし、
塗りまではそれなりなのに、絵としてパッとしないのは仕上げが下手です。

下手っていうとネガティブなイメージですけど、まだまだ伸びしろがあると考えて下さい。
塗りの勉強をするだけでグッと魅力的な絵に出来ると思って、取り組んでみて下さい。

後は、塗り方に合う線画というのもあったりします。
線太め、ベタ多めの線画で水彩塗りとかしてもミスマッチ感ありますし、めっちゃ細いペンでCG塗りとかもメリハリのない絵になります。
トピ主さんの線画に合う塗り方を探して、しっくりくるかどうか試してみて下さい。
デジタルなら、線画だけ残していろんな塗り方を試すことが出来ますし、
アナログでもコピーなどして同じこと出来るかと思います。

線画を描くというのは当たり前ですがそのモチーフのアウトラインを取るということです。
りんごならりんごの一番外側の部分を、恐らく黒に近い色で塗っている（描いている）。🍎
でもりんごを実際よく観察してみると、光の当たる部分、影になる部分というのが発生してます。
当然ですが、光が当たる部分は明るく、影の部分は暗く塗りますよね。
これを線画を描く時に意識するだけで結構変わると思います。
恐らく今はモチーフのアウトラインをかっこよく描けるように全神経を尖らせていると思いますが、
アウトラインというのは光を落とすだけで浮かんできます。
つまり全て黒く塗る（線画を引く）必要はないんです。

という考え方を前提に、
現在のトピ主が引いているであろうカッコいい線画に合ういいかんじな塗り方は
「背景を鮮やかな色でバケツ塗りする」
これですね！
アウトラインが綺麗に取れていて、そしてそれを活かしたいのであれば、そのアウトラインが綺麗に見える塗り方がいいと思いました。
線で影と光を表現するのか、色で影と光を表現するのかという考え方で、
今トピ主は線だけで影も光も表現出来ていると思われますので、だから色を塗ると微妙に感じるのだと推測します。

厚塗りメインで最近は線画を描かないのですが、描かなくても線画の練習は随時しています。多分厚塗りで線画が上手い人は同じようにやってるのだろうなと思いますね。

ちなみに私の場合は、ラフに色まで一度載せてその上で1度レイヤー全部統合して切取り変形・なんかヘニョヘニョしてる場所に色を置き直してからそのフチに線画を入れ直したりして整えてから作画してます。色を乗せた時の物の裏表や無意識にとらえていた厚み等を調整するのに良いと思います。

もう一つ線画で良く見えて色で悪く見えるは、ラフから線画にした時に劣化するのと似ている理由も一つあると思います。
・キャラクターの顔等の注目するポイントや明るい場所は、厚塗りでいう輪郭の内側に線画を描くとそれっぽくなり、影や接地面・重い物は輪郭の外側に線画を描くとそれっぽくなります。厚塗りでも重要なので結構これは練習しますね。

上のコメントの方も言ってますが、線画を描かない練習これもしてます、私の場合は形状の最低限認識できる線画と人の無意識に補完する線・粗密まで意識して線画の練習をしているので、3分の2くらい線画を描かないという練習まで極端になります。人の補完の位置を意識しながら色を入れてその後に線画を入れる。このようにまず、線画→色という順番から考え直すと良いかもしれないと思いました。

厚塗りばかりで線画の事など一切知らない絵描きの戯言ですが、頑張って！