とら専売、会場頒布価格(卸値)600円として入れてみたらちょうど944円になったからこういうことだと思う

本体（卸値）600円でとらの手数料と消費税合わせると944円になります。
別に944円に限らず中途半端な値段たくさんありますよ。
787円もよく見かけませんか？
それは500円の同人誌をとらに預けると787円になるからです。

本体（卸値）を調整して1000円ぴったりにしてもらうことも、もちろんできますよ。