トピ文の説明だけ読む限りは、ミュートされてるから見えてなくてTwitterでは反応されてないが
pixivはしっかりチェックしてる相手さんなのかな、と思いました。

失礼ながら、トピ主さんの説明文は読むのに非常にカロリーを消費する文章でした。
字か絵か分かりませんが作品は良いものを出されているかも知れないですけども
もしかしたら日頃のやり取りや日常会話では「疲れる」「苦手」と思われてミュートされてるのかも知れないです。

ミュートかどうか更に確認する方法はいくらかあります。
・名指しの空リプを送る
ミュート相手のツイートは通常TLには表示されません。
相手の作品ツイートや愚痴ツイートにいいねなどで反応した上で更に
空リプで「◯◯さんの作品オススメ」とか「わかるわー」とか空リプとしてツイートする。
当然、ただ相手がTLを見てないだけ、気が付かないだけということも多々ありますが
何度も同じことをしても相手から一切反応がなければミュートしてる確率は高いと推測できます。
　
　
・ブロック解除してからリプを送る
フォローしてないミュート対象からのリプは、通知欄にも表示されません。

パソコン版Twitterにはキーボードショートカットがあります。
相手のツイート画面で「X(エックス)」を押すとブロックするかどうかのポップアップが出て
そのままエンターやスペースを押してしまうとブロックしてしまいます。
相手のツイートに反応して「ぅゎ…」とリプするつもりが、返信アイコンをクリックし損ねてそのままキーを打つと間違ってブロックしてしまうということは割と「ありえそうな話」です。
そんな感じの言い訳を用意しつつ、ブロ解（＆フォローし直し）してリプを送っても反応がなければミュート決定です。
　
　
・えごったー有料版
確実ではないですが、有料版ではブロックしてる人・ミュートしてる人がある程度なら分かります。
えごったーの対象は、Twitterとえごったーを両方使っている人の中から、自分のことをブロック・ミュートしてる人を教えてくれます。
ミュートされてるかどうか気になる相手がえごったーを使ってなければ意味はないです。
１か月分の単体購入((660円))も出来るので、少しTwitterを整理したいという時に使ってみると便利かと思います。