なんだか全体的に重く考えすぎな気がします。
プロの人気作家なら分かるんですが、相手もただの作品ファンだし。
お礼して反応がなくなったのってトピ主さんのお礼メッセージが重かったからかな？って感じました。
自分ならこのトピ文の感じで恐縮されながらいいねやRTに細かくお礼を言われたらちょっと怖いと思ってしまいます。
Twitterも二次創作も気楽にやりたい人が多いと思いますし、そこまで怯えなくていいと思います。「私は大手よ！」なんて思ってる人いるんでしょうか？あんまりいないと思いますよ。適度な距離とマナーを持って接すればそれ以上のものは必要ないと思います。
自分はフォロワーが4桁ですが、6桁フォロワーの人に引用RTされても「ラッキー⭐︎」くらいにしか思いません。好きな作家さんには「めちゃくちゃ良かったです！大好きです！このシーンが特に最高でした！！」くらいのテンションで感想送ってますし、それで嫌がられたことは特にないです。
あと、トピ主さんがそうしているかは分からないですが「〜先生」「〜様」みたいな呼ばれ方をされるのは私はすごく嫌です。（アンソロのお誘いメールの宛名とかじゃない限り）
とにかく、相手が同じ界隈の人なら人気者だろうが大手だろうが、必要以上に敬ったりおだてたり特別視はしないほうがいいと思います。逆にうざいです。

途中まで、自分の話を読んでいるような気がしてくるぐらい共感しました…。
隙自語になってしまうんですが、私の場合は読み専と投稿専用で、途中からアカウントを分けちゃいました。自信が無い上に恥ずかしくて、もし他の作者様にウザがられてたらどうしようとか思っちゃうし、解釈違いでブロックとかなったら泣いちゃうなと思って。
今半年ぐらい経ってそれなりに評価して頂き、投稿専用のアカウントの方で作家様方にフォローして頂きました。そこから会話が繋がって、『え！？あのアカウント〇〇のなの？！』と驚かれ、送った感想が凄く嬉しかったんだと言われてこっちも幸せな気持ちになりました。
正直、アカウントを分ける前と後だったら全然気持ちの持ち方が変わりました。手間はかかりますが、常にビビりながら作品投稿するよりも、割り切って楽しむ方が自分は凄く楽でした！結構めんどくさいし、最初は反応全然貰えないけど、トピ主様がそれでも大丈夫なんだったらオススメです！

初々しくて可愛いと思いました。頑張ってね。
ただ、大手小手問わず同人作家さんは「創作する→見せる」を食事・呼吸の様に嗜む猛者なので、怖いとか悟られたら最後「あ、まだソコなのね」と一気に壁を作られてしまうと思います。書き手ならそういう部分は卒業して同士になってくれないとある意味ROM専さんより絡みにくいかもしれません。
大手さんに憧れたり純粋に今までの読み手の楽しみを維持したいならROM専の方が幸せかも…。
見ないで！ギャー！っていうのは一年もすれば無くなりますが今までの楽しみ方や気楽さ、書き手さんからのROMさん向け手心も無くなります。あんまいい事ないかもしれません。
でも創作する事で何にも代えられないモノがありますよね。貴方の読者のために頑張ってください。