12.9インチのiPad proで作画から入稿までしています。
ネームをA4二つ折りなどの原寸A5サイズでやって、作業画面を単ページ表示にし、印刷原寸表示で描画して、製本プレビュー機能でチェックしながら進めると違和感が減らせると思います。

枠線と基準のフォントサイズは実際に印刷して決めました。
作画面も、事前に印刷した自分の原稿を時々見ながら感覚を合わせたり、線もですがトーンの削りが多いページは実際に印刷してみると荒に気づけたりも。プリンターがなかったりコンビニが遠かったりすると難しいかもですが…。
単位表記をピクセルからミリに変更してからは線の太さのイメージがつきやすくなったかな？と思います。