まずは自分がどんなツールやソフトを使って絵を描いているのかを記すとコメントが付きやすくなると思いますよ。
バケツ塗りをすると線画と塗りの間に余白が生まれてしまうとありますが、おそらくそれは線画のアンチエイリアスがオンになっているからだと思います。
「アンチエイリアス　バケツ塗り」と調べると解決法がいくつか出てきます。

私は下書きレイヤーの下にレイヤー作成→大まかな色を塗る→レイヤー統合→直接厚塗り、という方法をよく選んでいます。
線画を描く際には細いペンを使ってますね。
塗りで気をつけていることは画面全体の色のバランスですかね。引きで見て良い感じかどうかを確認しながら描いてます。

私ははみ出しまくりで一旦塗り終わったらはみ出しを消して修正するよ
塗りのレイヤー数枚で塗ってる
線は太かったり細かったりかな

上のコメにもあるけど元々トピ主がどういう塗りしてるのかわからないとアドバイスとかしにくいと思うよ
アニメ塗りとか厚塗りとかレイヤー1枚なのかパーツすべてレイヤーわけてるのかとか
それはおいといてみんなのいろんな塗り方聞きたいとか

線画は別レイヤーにして内側を範囲選択
↓
選択範囲を1〜3px（線をはみ出さない程度）拡大
↓
塗り

これをアクション登録してボタン一発でできるようにする
クリスタなら素材ポータルで「囲って塗るツール」で検索して出てきたブラシをインストールして使う

自分の線画は細いのから太いのまで様々