少数派でもないと思います。むしろそっちの方が多いような。二次創作にそこまで史実的要素を求めてなくてCPのイチャイチャがみたい方も多いでしょうし、自分もそういう時があります。

ただ自分で書く際は関係性があるキャラ同士にはまることが多いので、史実やそれに基づいた関係性などをいれて書いています。歴史オタクでもあるので、史実や史実の関係性優先ですね。

トピ主さんのおっしゃられているのが、史実としては接点などがないキャラ同士のＣＰなのか
その歴史をモチーフとした作品内だけでは絡みが作られているカプなのかが分からないので的外れだったら申し訳ないのですが……。