①御礼カードに「ありがとうございます」と明記するだけに留めています。差別化することでBOOSTがないと「特典がもらえない」という状況を回避するためです。

②大して御礼してないでありません。

トピ主さんの例はかなり特殊な状況なので、ここでご意見を伺っても、あんまり意味ないと思いますよ。

どちらも経験あります。
①描き下ろしイラストと個包装の紅茶パックを封入
イラストはおまけ用にミニキャラ等を描き、コンビニコピーして空きスペースにお礼メッセージを手書きして入れてます。
紅茶は自分が好きなお店の季節限定の味などを入れてます。本の感想と一緒に「封筒を開けたら紅茶のいい香りがして気分が上がった」等複数コメントいただけたことがあります。

②漫画描きさんからは描き下ろしポストカード、
小説書きさんからはSS折本をいただいたことがあります。

①前ジャンルではしてた。お礼用ペーパーをこっそりつけてたのでたぶんBoostしてくれた人以外は誰も知らない。(あとでBoostのお礼とは一切触れずweb再録した)
今はお礼メッセージを送るだけにしてる。

②手作りのシールとか、ポストカードをいただいたことがある。正直使わないので困った。

①本の内容に沿った3〜4コマ漫画を載せたペーパー
②もらったことがあるのは、手描きのイラスト（新刊のメインキャラ、バストアップ線画）が描いてあるカードやペーパーなど。手書きで「Boostありがとうございます！」って書いてあるメッセージカードなども。

①基本的にはお礼状に一言「boostありがとうございました」と書き足すだけ。元々ポストカードがオマケに付く本の場合のみ、boostくれた人には同じポスカを2枚付けたことはある。

②お礼一言のパターンが多い。そうでない場合ポストカード1枚とか、自作グッズのシールとかかな。

自分がboostもらうと恐縮して何か付けたくなっちゃうけど、描き下ろしとかだと「boostしてない人は見られない」＝「見るにはboostが必要」ってことになってしまうので、くれた人のご厚意は気持ちとして受け取っておくに留めて、物品で返さない方がいいのかな〜と思ってる…。

①してない
発送完了メッセージでboostへのお礼を述べ、何もお礼できないがいただいたboostは今後の活動費として大事に使いますみたいなことを伝えます
これをすると中身をboost用に分けたりする事がないので…100件以上扱った時にミスらないようにこのような対応にして以後続けています

①数年前、世間知らずで何もしなかったことがありました。せっかく応援してくれたのに…
②お茶でもしてくれと思って+1000円。
　便箋2枚の直筆お手紙をいただいてしまい恐縮でした。

①してない
漫画描きです。トピ主さんほど高額のboostはいただいたことがないので参考にならないと思いますが、差し入れにお菓子を貰ったつもりで特別なお礼はしていません。boost関係なく同じポストカードをおまけにつけます。

新刊買った全員につけてるおまけペーパーに「Boostありがとうございます！」って手書きで書き添えてそれだけです。
でももらう方にはわりと好評だった。

①ポストカードサイズの用紙に簡単なイラスト＋BOOSTありがとうございますのメッセージを書いて同封しました

②メッセージカードに簡単なイラストとお礼メッセージが多いイメージです
表紙裏に簡易イラスト＋メッセージを描いてくれた人もいて、漫画家のサイン本みたいで個人的に嬉しかった

①倉庫なのでしてない。でも買い手は自家通販と倉庫の区別がついてない人多いみたいなので、不愛想だと思われてそうだな…とちょっと気になってる。メッセージだけでも送った方がいいのかな
②数百円ブーストした時、たしかありがとうございますって一言メッセージ入ってた気がする。やっぱり反応があると嬉しい

②
半数くらいは何もなし
たまにカードに「ありがとうございました」のメッセージ
お礼状にキャラのミニ絵があったり…
少額しかしてないから何も求めてないし、何かあると恐縮しちゃう

①全員に付けてるペーパーの空欄かメッセージカードサイズのお礼状にboostありがとうございます！って書いて、金額関係なく表紙絵のカードだったりポスカだったりを同封してます
嬉しいですと言われたこともあるし、逆にいらない場合も捨てやすいかなと

②カードサイズの用紙に手描きで新刊カプの絵
　写真用紙でチェキ風イラスト　など

①発送メールに「BOOSTありがとうございます」と書いています。
②BOOTHで買う時はBOOSTしてます。大体半分くらいの人からは発送メールにお礼が書いてあったりポストカードやSSが付いていたりします。なくても気にしないです。

１　ＢＯＯＳＴ貰った事ない　するなら小さい書き下ろし絵入れたい
２　基本的に１００～２００円ＢＯＯＳＴする
小さい紙（名刺～ポスカ）、眼鏡拭き、クリアファイルとかもらった

①12～20Pくらいのコピ本漫画をお礼に同封しています。お礼ありますと明言していないので、boost自体は1件来るかな？程度です。
②boostありがとうございますのメッセージカードが付いていました。

①発送連絡時に「BOOSTありがとうございます」と付け加えています
②する額は500～1000程度で大体は同じように「ありがとうございます」の言葉だけですが、直筆イラストカードつけて下さった方がいて逆に恐縮してしまい、その方には次からBOOSTできなくなりました
もちろん嬉しかったですけどそれ以上にお手を煩わせたくない気持ちが勝ったので…

①BOOTHのメッセージで御礼を伝えるのと、全員に入れてるメッセージカードに「BOOSTありがとうございます」と手書きで書き添えるくらいです。
②私がするのと同じように言葉のみが多いですが、BOOSTした人専用オマケ（書下ろしSSなど）をいただいたことはありました。

個人的にはBOOSTしたときに（創作物の）オマケが付くなら最初から言っておいてほしいタイプです。
一方、自分では「BOOSTくれた方には●●します」なんて表でとても言えないので、BOOSTの有り無しでおまけを変えることはしない運用に落ち着きました。