それは不安になりますね。
ただ、自分も以前アンソロアカウントにフォローされていなかった経験があるのですが、その時はこちらもアンソロアカウントがある事に気づいていませんでした……。（主催からは直接メールで連絡が来ていました）
まあ気になるようでしたら「参加するのでフォローバックしてください」と、はっきり主催のアカウントなりアンソロアカウントなりに突撃したほうがいいと思います。アンソロ主催というのはどれだけ慣れているように見えても意外と中でテンパっているものだと思いますよ。
また、「他の人から見れば参加するなんて思われていないだろう」と書かれていますが、大丈夫！大体においてアンソロなんて、誰が参加しているのかよく分からない謎の本です！黙っていて辛くなってしまう事は早めに解消しましょう。

5Z9igjvkです。
トピ主はおそらくアンソロ初心者なのだろう…と思いましたので、ちょっと踏み込みますが。

DMが来たということは、連絡が取れているんですよね？
もしフォローしていない事で大事な連絡が取れなかった…という事があった場合、それは主催の責任です。トピ主のせいにはなりません。
それにアンソロで大事な連絡といったら「原稿のフォーマット」「締め切り」「原稿の受け取り確認」「完成アンソロの受け渡し連絡」これで全てです。
上記の内容はアンソロ主催者と確認できましたか？
もし上記の確認が取れていない場合は、きちんと連絡を取りましょう。

わざと悪い言い方をしますが。今回の件に限らず、アンソロなんて主催と作家の間のトラブルは絶えません。
途中で企画が空中分解して、寄稿者に原稿返却して解散したケースだってあります。
……ある程度は「アンソロに参加する以上、何か不愉快な思いをするかも知れない」と割り切る必要があります。

もちろん同じ寄稿者なのに扱いが平等ではなかった、という悲しい気持ちは分かります。
でも、アンソロに参加する以上見てくれる人は居ますよ。新しいファンを獲得できるかも知れませんし。

他の方はアンソロ垢をフォローしていてフォロバされているだけ、という訳ではないんでしょうか。トピ主さんはアンソロ垢をフォローなさっていますか？
もし既にフォローなさっている場合、主催さんがTwitterを見ていそうな時間帯に1度フォローを外して再度フォローしてみてはどうでしょう？(通知オフ設定にしていなければ)相手に通知がいくので、さりげなくアピールできるかもしれません。
もしかしたら特に区別する意図はなく、フォローしたつもりが漏れていただけかもしれませんし。

経験から言いますが
やめた方がいいです そういう気の回らない差別的な主催者では この先貴方は苦労します 嫌な思いも増えます
貴方の貴重な時間と原稿を裂いてあげるのは勿体無いですよ
参加者の内フォローするしないを分けた上にそれで良いと思っている主催者は本当にやめた方がいいですよ

アンソロはある程度嫌な思いをすると割り切れという意見もありますが 無償の趣味にそんな義務有りません
日本特有の奴隷根性に染まらない方がいいです