フィクションだぞ！しかも素人の創作だぞ！(プロだったらすみません)ってことで気にせず自由に描けばいいと思うのですが、ご自身が気になってしまうのなら納得してから描けた方がいいですよね。
上の方の返信にある「良い体してるね〜」は前後の雰囲気知らずにそのセリフだけ見た私は、スポーツしてる人や体鍛えてる人に対しての賛辞の言葉っぽいと思ってしまい、セクハラっぽいとは思いませんでした。
でも体つきに対する言葉を言うってだけでセクハラだと思う人もいるでしょうし、そんな感じで受け手により感じ方が違いそうなので、やっぱりトピ主さんの表現したい通りに描いたらいいと思うのですが。
それに文句を言う読者がいたら、合わなかったということでしょうし。

同じことをしていても、双方の信頼関係とか力関係によってハラスメントになる/ならないは変わってくると思います。
信頼関係があり、力関係がほぼ対等な二人が、多少過剰なスキンシップがあっても、お互いが嫌だと思っていなければセクハラだとは思わないです。
人によって嫌だと感じることってそれぞれ差がありますし…文化的な差もあるし、個性としてもありますよね。
特定の行為に対して「これをしたらセクハラ」というよりも、相手から「嫌だ」と言われても「嫌よ嫌よも好きのうち」的に勝手な解釈でスキンシップを続ける心性にハラスメントを感じます。

スキンシップされた側が焦ったり引くような行動を見せたときに、した側が「やりすぎた」と感じて一歩引く。それに対してされた側が寂しく思い、それがなぜなのか考え、「もっとされたかった」という自分の本心に気づくような描写があったら、個人的にはセクハラだとも思わないし、二人の葛藤にすごく萌えます。

描き方次第でそれ自体はセクハラになりうるかもしれないと私も思いますが、その行動を否定的な文脈で描けば問題ないと思います。
「無自覚でセクハラしてしまうところがある」という性格（？）を、欠点として描けば問題はないと思ってます。
どんなキャラにも欠点があることが多いですが、たとえば「口が悪い」みたいな欠点をカッコよく描きすぎると、度が過ぎれば読んでる人は「ただ人が傷つけること言ってるだけじゃん…」となってしまうこともあると思います。
ですが、「口は悪いけど優しい」とかであれば、「けど」と言ってる時点で「口が悪い」は欠点だと作者や登場人物も捉えていることが分かるので、反感を抱きにくいはずです。
それと同じで、「セクハラしがちな性格」も欠点として描き、セクハラシーンはちゃんとセクハラシーンとして描くのなら、何の問題もないのではと私は思います。

あとは、セクハラされた側が多少嫌がったりして、セクハラした側が謝るとか、嫌じゃないにしても「俺は良いけど他の人は嫌がると思うから気をつけなよ」とか言ってる方が、個人的には読んでて嫌な気持ちにならないです。
トピ主さんのだと、嫌がって謝るパターンかなと思うので、たぶん私は読めます。

ただ、トピの内容的に読者は女性中心になりそうですが、セクハラされたことがあったり、日々警戒している人の場合、「セクハラしがちな人」というのは変に生々しくて、嫌な感情を抱きやすそうではあります。
「口が悪い人」とかと違って、「欠点だけど萌え属性」として楽しむことはできない人も多いかもしれません。
ましてやもし二次創作であれば、推しがセクハラするのなんて見たくなかった！となる人もいそうです。（原作でもそういう性格なら別ですが）
なので、そのキャラがセクハラする描写があるというのは、一次でも二次でも注意書きした方が双方のためかなと思います。

要は恋人未満なのに無自覚に恋人スキンシップをしてくる萌えを表現したいのに、セクハラと捉えられないか、という事ですもんね。
意図的な方に改変してしまったらもうそれは違うものになりますよね…
一言受けに「それ恋人にするやつ」「好きな人にはこうなのかな」などモノローグや台詞で言わせたりして、
書き手の「攻としては恋人に対する言動である・無自覚な所が萌です」と、明確に読み手に示すのがいいのかなと思いました。

セクハラは確かに受け手がどう思うかの問題ではありますが、翻って言うと全て受け手の責任、受け手が考え方を変えればセクハラした方は何も改善なくて良いという読まれ方になると嫌なので、 その後に「無自覚でしてしまう所が自分にはある」と攻自身が内省する場面があれば、個人的にはこの作者さんは信用できる…となります。
無自覚だから言ってもらって改善していきたい攻→これからは照れて言いにくかったけど嬉しかった事はちゃんと言っていこうとなる受で、 お互い対話をしていこうという感じが高まって良いかなと思います。