前編100部として中編後編50部くらいでいいのではないでしょうか。
前編さえ残っていれば中後編は同等くらいで捌けると思います。
続きものは嫌がられるというか、前編が在庫切れしたら中後編買う意味がないからです。

買う側としては途中からトピ主さんの本を好きになって買おうとしたら前編のみない状況なら中後編も買いませんよね。
再販される見込みもないし、かといって中後編買って、前編の再販待ってたら前中後総集編出します！パターンもあり得るので続き物作品は怖いです。
なら最初からまとめて出してよ…ってなります。
まあ、これは買い手側のわがままですけど。
できれば一作品として出して欲しいです。

経験者ではなくこれから同じ事をしようとしている者です。
参考にはならないと思いますが、私も気になる質問なのでコメントさせてください。

私の場合、前編は特に深く考えず、これくらいならすぐに捌けるかなと思った数を刷ったところ半分近く余ってしまいました。あちゃーと思いましたが、続きものなのでこれくらいでちょうど良かったか、とも思ったりします。

中編も前編と同じ数を刷る予定でいましたが、在庫を抱えたくないと思うようになったので、確実に捌けそうな数（前回の1/3程度）を刷ってみて、完売したら再販しようかと考え直しているところです。
再販をかけると割高になってしまうので悩むところですが、今は少部数でも安く刷れる印刷所がありますし。
最終的に前・中・後編で在庫数がバラバラになってくることが予想されますし、どう調整していくかが悩みになってきますよね。

シリーズものの発行部数悩みますよね！
私も皆さんの体験談、お聞きしたいです。