トピ主さんの感性わかります
自分も意味があるもの以外はモヤっとしてしまいますね、その不条理さを楽しむ作風ならば呑み込めますが
たとえば例に挙がっている「真面目な性格として描かれたキャラが脈絡なくポイ捨てをする」が、実際は「主人公が真面目な性格だと思い込んでるだけで実際はそうでもない」というギミックであれば納得できます
批判意見については、未完結の作品であれば将来的に伏線回収される可能性があるため「真面目だと思ってたのにイメージ違った」くらいなら許容範囲です
完結作品ならモヤモヤしますね…

そして家庭内スキンシップは「ギャグで済まされてるけど主人公の父親が家庭内でセクハラしてる作品」って言っちゃいますね

昔手塚治虫の作品でそんなのあったなあ…と思いました
(ある日主人公以外の倫理感が逆転かなんかして、食事がエロい行為になったり人殺しがごく普通とかになる。主人公だけが現代日本の感覚で戸惑いまくるみたいな話)

上記みたいな、違和感自体が伏線だったり話のタネだったら面白く読みます。
明らかにファンタジーぽい、もしくは「この国ではこういう習慣がある」みたいなモノローグなり話の流れなりフォローがあれば、現代日本や自分自身に背いた価値観でもお話として消化します。

でもフォロー不足とか、そんな描写も一切ないとかだと、私も他の方が書いている通り作者を価値観合わないboxに入れてしまうと思います。
トピ主さんの書かれている例はどれもフォロー欲しいところですね。。

とはいえトイレ行く描写が全くない！とかは全然気にならないので、人によって許容ゾーンは違うんだろうな…と思います。

フィクションに対する表現の境目、私も興味あります。

＞その不条理さを楽しむ作風ならば呑み込めますが
極端な例の話も、成人向けとかならわかるし見られるのですが、全年齢向け作品でこの描写をされるとおかしく感じてしまう…というような感じです

＞嫌なら黙って離れればいいんじゃないの？
いつも思うのですが、批判は許されないのに、批判への批判は意見として許されるのはなぜなのでしょうか？
「公式情報やファンアートだけ見たくても、ネットなのだから地雷がある方が検索を控えよう」という風潮なのに、批判に関しては適用されないのは矛盾に感じます。

＞その作品で同人やってるわけじゃないなら批判していいと思う。
「同人」どこまでの行為指すかにもよると思いますが、「同人活動＝「好き」の部分を表現しているだけ」だと思っているので、「同人者＝公式を全肯定する信者であれ」という考え方はよくわかりませんでした。
今時は公式が同人OKを出すところも多いですし、「違法行為をお目こぼししてもらっているのだから、文句は全て飲み込め」とは一概に言えないのではないでしょうか？

＞極悪人が銀行強盗してても気にならないけどね
まさしくその通りです。
作者にそのつもりがないのにそう描かれてしまうと気になる…という話です。

＞あくまで自分は不適切だと感じているだけであり、それが正しく相手が間違っているという訳では無い事は忘れないようにしないとなとは思いますが。
とても正しいコメントだと思います。
その通りですね、ありがとうございます。

＞「フィクションなんだから」の許容範囲とその理由について知りたいです。
自分は、その作品の公開の仕方、ゾーニングが正しければ正直フィクションならなんでもやっていいと思うかも。

例だけど、子供に手を出してる成人向け漫画とか、主人公がカスの青年漫画とか、それならそういうもんだよね。と思う。フィクションをフィクションとして理解できる年齢層向けだと思うし。
ただしお茶の間に流れるテレビドラマ、子供向けアニメとかで、トピ文にあるような父親から娘へのセクハラが許されているかのように描写されてると、おい！！！！ってなる。フィクションでも許したくない。

うまく伝えられてるかわからないけど。トピズレしてたらごめんね。

物語における倫理観の是非って、夏目漱石あたりが評論で書いていたような記憶が。
それはともかくとして、「人間（キャラクター）」を書くことに重点を置いているのであれば、「倫理観」の問題からは離れられない。
「善良な人間」の「善良性」を何を持って描写するのか。その逆に「悪徳な人間」はどうか。それがわかってないとダメと思う。
ただ、こういった価値観というのは時代や文化によっても変わって来るので、常にアップデートが必要になる。だからだと思うけど、プロのエンターテナーはインプットし続けている印象がある（この辺りをうまく操作して描いているのがSFやファンタジーというジャンル）
その結果、「このキャラはこういう倫理観だから、こういうことをする」の積み重ねで描いていることが多い。
余計な描写はしない。
これに尽きる。
「神は細部に宿る」という言葉があるように、ほんの小さな積み重ね、その描写がキャラクターを作っていて、物語になる。
「フィクションだから」といって、細部を怠ると説得力が生まれない。
そういう細部で引っ掛かることをわざわざ持ってくる場合、それ自体が何かの伏線か、作者に力がないかのどちらかの場合が多い。

後者の場合は「合わない」ので、私なら読みませんし、トピ主さんと同じようにツッコミを入れますね。プロの作品なら。
素人作品なら、黙ってバイバイ！

善良なキャラが普通にポイ捨てしてて作中でそれに突っ込みゼロは違和感が強い、話のノイズに感じる、という話に対して、現実で道が汚れるわけじゃないから関係ないとか嫌なら見るなとか言われても…と思う
設定と描写に乖離があると萎えるがその線はどこか、って話だよね
例えばツッコミとして1トンハンマーでどついてたんこぶ出来てたとしても、人をハンマーで叩くなんて最低とか暴力反対とかは思わない
漫画的誇張なのは明らかだし1トンのハンマーを持ち上げられる人間はいないから、それくらいは漫画的表現の一つとして許容の範囲内
でも暴力をギャグにするのは一律にダメ！という人がいたとしてもそれはそうだよねと思うよ

私が個人的に無理なのは、おとなしくて恥ずかしがり設定の女の子が体の線がきっちり出てたりすごいミニスカートはいてるキャラデザ
あとガサツでズボラな設定のキャラが特に理由なくものすごいロングとか凝ったセットの髪型してたりするのも苦手

上の方と同じく、倫理観からズレたものをあえて描いているいう描写、そうした作者の発言があれば楽しめますが、制作者の方の感覚がズレてるものについては、好きではないので避けています。

フィクションなんだから気にするなという表現も好きではありません。フィクションでもとても満足度の高い、描写力もしっかりしている作品もあるんですから、それはつくりの甘いものを見たと思って忘れます。

トピ主さんの言う通り、真摯に向き合っている他の創作者もいらっしゃいますし、そういった創作者の方々を応援したいと思っています。

ただ、倫理観のずれや物足りなさのある作品、合わない作者に付き合う時間がもったいないので、合わないものからは離れます。

また、そういった作品が多かった場合、作品を楽しむ行為自体、もう自分に合わなくなったと判断します。