■自動
こちらのサイトのツールはどうでしょうか？
　https://ysklog.net/tool/twitter-delete-tweet.html

・web上で削除
　APIの関係で3200件しか対象にできないため、抽出しても3200件の内400件しか消せない、などになりがち
　何度か削除を繰り返すことで全ツイート削除が可能？
・ツイートデータから削除
　Twitterから取得できるtweet.jsを使った削除
　tweet.jsを加工してアップロードすることで絞り込んだ削除も可能になる可能性あり
　ただ現在仕様変更にともなって、このツールでは削除できない可能性も高い

私の方で試せる（最悪、全ツイート削除してもいい）Twitterアカウントがないため、手放しにおすすめできるものではないですが紹介という形だけコメント残しておきます。
規約や仕様をよく読んだ上で使ってみて下さい。
　
　
■手動
以前知り合いがツイート削除をしていたときは、Twitter内の検索で該当ツイートを検索→削除をして
その後、全ツイート取得をして消せてないツイートがないか文字列検索→漏れがあればURL辿って手動削除していました。
シャドウバンになっていたり、あまり古いツイートは検索に出てこなかったりするので
全ツイート取得して探すのは良い方法だと思います。
　全ツイート習得の方法
　https://www.howtonote.jp/twitter/helpful/index1.html
ただし、このやり方はパソコンでしか出来ません。
　
　
■まとめ
削除したいツイートの数にもよりますが、自動ツールよりも手動の方が確実性高かったりもするので、それはトピ主さんが判断して選べばいいかなと思います。