短編が書けない！　ってトピもたま〜に見るよ
たいていの場合はトピ主に短編に対する興味が薄いか、書くときの縛りが少なすぎる（筆の赴くままにあれこれ書きすぎてる、作品の制御ができてない）って感じがする

そもそも「書きたい場面が何個か思い浮かぶ」という時点で短編向きのネタではないんだよね
短編ってどの程度の字数を想定してるかわからないけど、〜1万字くらいまでだと、せいぜい「導入→1場面のエピソード→まとめ」くらいしか書けない
それを前提にネタ出しすることから始めたほうがいい

まずは商業のいい短編をたくさん読むのがおすすめ。オムニバス短編集とかいっぱい出てるし好きなの参考にするといい
「三題噺を800字縛りで書いてみる」とかのトレーニングもいい
あとはプロットを立てて話の筋が逸れないように気をつけること
あと、裏設定を考えてもいいけど、作品の中で語りたいという色気は抑える。別の短編を「前の続きです」って感じで続けたり「あの短編が膨らんだので長編にしました」ってしてもいいんだから

最後の質問は「短編が得意な方はどうやって話を組み立てていますか？」の書き間違いかな？(じゃないと文脈がチグハグですよね。違ったらすみません！)
短編がまとまらないのはネタが多すぎる可能性が高いです。私はいつもワンライでは6千字以内の縛りで書いているのですが、ネタは必ず一つだけです。
更に一つのネタに対してテーマは複数あった方が纏めやすくなります。
例:ネタ「ABがカフェでまったり」
　テーマ:『花』『光』『蝶』
　→組み立て方。光が差すカフェの店内。AはBを光に照らされた花のようだと思う。自身のことは花に集まる蝶だと自嘲する。でもBはAのことを光だと思っている。
こんな感じで、後は動作を交えつつ簡潔に起承転結を意識すると短くまとめられます。

これ10年仲良くしてる神が同じこと言ってたわ。
神はほんとに上手いのですが、私みたいな理詰めにしないと長編書けないタイプと違って、10年続けてるからこその感覚でもう書いちゃってるんだろうな〜これも才能なんだろうな〜才能は羨ましいな〜でも努力もあるか〜と思ってる。
その神になりたいかと言われたら、私は今の自分のスタンスに自信があるから、思わないけどね。ちなみに私は複数プロット組んで展開に合わせて柔軟にシナリオを曲げていくタイプです。

これに関する言語化は本人にしか出来ないだろうなと思ってるから長編しか書けない話には、正直すごいと思う！としか返せないなと思ってる。
別に自分のスタンス貫いたらいいんじゃないかな。