そのアプリの機能がよくわからないんだけど、シーンごとに目次をつけて、目次一覧ページから項目をタップ→該当のシーンに飛ぶ　みたいにはできないの？
それか自分でシーン冒頭に印をつけて検索するとか
長くなりそうなシーンだけメモ帳アプリに引っ越すとか

プロットといっしょにセリフも書き留めるのはいいことだと思うから、無理して箇条書きにする必要はないんじゃないかな。
ちなみに私は普通のメモ帳アプリでシーンごとにメモを分けて書いて、本文にコピペしてる。執筆アプリが使いこなせなくて……。

むしろセリフだけ書いて、あとで情景描写を入れるような書き方をしている。描写部分でセリフがいらなくなったら、削ったりして。
短編並の長さというけど、本編が長くなるなら、プロットも相応に長くなるのは仕方ないと思う。

その方が良いんじゃない？下書きみたいなものとして扱うといいかと。私も良く箇条書きから派生してセリフも書き始めちゃうからわかるよ。
ちなみに読み返す時に確かに見辛いから、付箋で「どこどこのシーン」ってわかるように目印つけてる（手書きなので）。
アプリならコメントの追記とか、そういう機能があるソフトを使うと良いと思う。
グーグルドキュメントは出来たはず（冒頭h抜いてます）
→ttps://support.google.com/docs/answer/65129?hl=ja&co=GENIE.Platform%3DDesktop#zippy=

プロットは箇条書きというか、シーンのサマリを書いてるな
プロット機能がどんなもんかわからないけど、文章を構造化するといいと思うよ
自分はメモ帳だけどそうしてる
まずそのシーンを一言で表す一行を書いて、その下にもうちょっと詳細なシーンの内容を書いて
細々したセリフを思いついたら一番下にどんどん書き足していく
文章に見出しを付けてブロックでわけるイメージ
そうすればプロット部分を参照したいときは上の方見ればいいし
セリフ参照したいときは下の方見れば良い
出てきたもの書き留めておくのは本文書く時間の短縮にもなって良いと思うから、参照方法だけ見直せばいいんじゃないかな

皆さん、アドバイスをありがとうございました！
すごく光が見えて来ました！
これからはもっとやりやすくなりそうです！
相談して良かったです！
本当にありがとうございました(*´▽｀*)

思いつく会話を書くのはいいと思う。でもそれは「メモ」であってプロットじゃない。
そのやり方だとあとでセリフの引き算になる。ストーリーにしまりがなくなるし漫画みたいな文章になる。
頭を整理しよう