自分も同じ流れで出張編集部から仕事貰ってますね。
２社と電話打ち合わせしたことがあります。

雑誌の特色にもよりますが最初の電話では、
・今自分の会社で募集している仕事はどんなものか（オリジナルBL作家、コミカライズ作画等）
・デビューするまでの道筋（まず社内賞レース用のネームを作る必要があるなど）
といったことを話しました。お仕事の案内みたいなものですね。
単価やスケジュール感も聞けます。
自分は元々フリーで働いていて、新しい仕事の開拓として行ったのでそのまま受けました。
それでも改めて資料を共有したりする段階が挟まりますので、即お仕事開始って訳じゃないですよ！落ち着いて大丈夫だと思います。

トピ主の場合は素直にそのまま言えばいいんじゃないでしょうか。
まずはメールで『仕事があるので精力的に商業活動するのは難しい』『今二次の原稿の真っ最中なので、すぐには何もできない』ことを伝え、『ちなみに打ち合わせではどのようなお話になる予定でしょうか？』と聞けばいいかなと。
出張編集部で一度直接話してる方ですし、そこまで硬くならずざっくばらんに聞いてみていいと思います。