地球外生命体のデザインそれ自体も、ストーリーの内容に関わってくるのではないでしょうか？

登場人物と全く心通じ合わない存在として描くなら、ヒト型とはかけ離れた無機物的で不気味なデザインにするのが効果的だろうし、
人類の新しい友達的なポジションとして描くなら多少は人間が見たことのある生き物に似たデザインの方が受け入れられやすいと思います。

地球外生命体が生きている環境によっても形は変わると思います。

「地球外生命体の真の姿とは？ 科学的に考えてみる」、の記事によると
重力が大きい星では背が小さくずんぐりとした体になり
重力が小さいと背が高いヒョロっとした生き物になるそうです。

他にも色々な観点から地球外生命体の外見について書いてあったので記事を参考にしてみてはどうでしょうか。