'00年代に商業漫画家デビューした者です。
人により考え方はいろいろあって、どれが正しいとは言えないので、私の記載は参考程度にしといてください。

私のペンネームは漢字と平仮名で構成しましたが、
私が重要だと考えたのは以下の４点です。

１．
まず、商業作家になると、どうしても店での打ち合わせや飲み会の機会が有るので、公共の場で呼ばれても大丈夫な名前、という事は最優先に考えました。
『サルでも描けるまんが教室』（相原コージ、竹熊健太郎・共著）において、恥ずかしいペンネームの例が面白おかしく描かれていて、これはダメだな！w と強く思ったので。

２．
次は、最初の点とけっこうカブるんですが、漢字を使ったので、初見でも一発で迷いなく読める名前を考えました。
他人様から「○○先生」と呼ばれる事も増えるので、余計な思考をさせずズバッと呼んでいただけるように。

３．
次に、検索で唯一引っ掛かってくれる名前を考えました。
上手い作家さんなのに、「左」とか「御免なさい」とか、検索する時にいちいち「イラストレーター」「漫画家」って付け加えなきゃならないのは面倒ですから。

上記３点に共通するのは、他人様が自分のペンネームを扱うにあたって、スッと楽に扱える、という事です。
私の漫画は娯楽方面なので、読者さんにストレスを与えず楽しませたい、と常々考えています。
ペンネームにもその考えを適用したい、と思ったのです。
それも含めて作品であり仕事だと考えたからです。
ただ、最初に申し上げた通り、この考えが必ず正しいわけではありません。
作家の方向性によっては、「全然読めねぇ！」が「正しい」こともあります。

４．
そして、最後の１点は、画数判断です。
「オカルトじみた、おかしな事だ」と思われたでしょうか。
しかし、我が子に付ける時のように、そこまで考えて付けた名前なのだ、という、自分なりの納得を得たかったですし、場合によっては「変えることができなくなり」死ぬまでの付き合いになるかもしれないものですからね……（「モンキーパンチ」は、ご本人は最初すごく嫌だったらしい）。

もし、本名で呼ばれるよりも、ペンネームで呼ばれる事が「普通」になると、その名前が「運命になる」……とは思います。