今度初めての同人誌（小説）を作成予定なのですが如何せん初めての事だらけで混乱しています。

当方、環境がクロームブックのためワードが使えません。
なのでしめけんプリントの小説pdfメーカーを使ってデータ作成をし、おたクラブさんで入稿と考えております。
おたクラブさんはwordでのpdf書き出しを推奨しているため、この方法で文字化けもなく無事作れるのか不安です。

こういった無償ソフト、ツールでのデータで入稿しても特に問題はないでしょうか？教えていただけると嬉しいです。