狭いジャンルであれば上の方がおっしゃるようにミュートの方が穏当かもですね…　自分は、よほど積極的に拒絶の意志を示したい時以外にはブロックは使わないです。
ミュートでは空リプが見えてしまうということであれば、ワードミュートに相手のハンドル名とアカウント名を入れたり、何かのRTの言及っぽいツイートを見かけても深追いしないなど工夫をされると良いかと思います。
ただ、フォローしてない人をミュートするとTwitterの仕様上通知も来なくなるので、相手が何かの用事でトピ主さんにリプライを送ってきた時に気づかずに無視する形になってしまうリスクがあります。たまにリプ欄の数字を確認するなど注意が必要になりますね…

共通の友人には、DMなど一対一で頻繁にやりとりするくらい仲のいい人で、かつその相手が多く話題に出るようだったら「ちょっと苦手で…」くらいは話のついでに伝えてもいいかもしれませんが、状況によるので一概には言えないと思いますね…。伝えた友人に気を遣わせることにもなるので、親しさの度合いやその友人がどれくらいお相手と仲が良いかなど状況を見ながら探り探りになると思います。