CMYK＋多色で入稿する際のデータ作りについて。

みなさん、原稿進んでますか？
最近同人誌を作り始め、ちょっと変わった本を作ってみたくなりました。
CMYKに＋一色、あるいは二色で印刷してみたいと考えています。
印刷会社のマニュアルを見ると、CMYKのレイヤーの上に追加の単色レイヤーを置くようになっています。あるいは、CMYKのデータと単色データ、2つを用意するように指示があります。
そこで気になったのですが、単色の上に、さらにスミや掛け合わせの色を置くことはできないですよね？
また、そうした表現をしたい場合は、単色レイヤーで該当部分を抜き、
CMYKレイヤーに抜いた形のパーツや文字を置く…って感じであってますか？
箔押しの話はよく見るんですが、インクを増やしている人の話はあまり見ないので（それぐらい簡単ってことなのかな）、気になって質問させてもらいました。

追加インクを使う場合の版ズレを加味するとか色透けなどの注意事項、データ作りのコツなどありましたら、合わせて教えてもらえると嬉しいです。