頭の中でメモ庁舎の白くてでっかいビルが建ってしまい、質問の内容が何も入ってこなかった
ごめん

自分はevernoteにちょいちょいメモってます
タグづけでネタとプロットと分けて管理する感じ
必要に応じて、イメージになる画像を貼りつけたりもできて便利です
PCやスマホなど複数の端末でそのまま参照できるのも楽ですね

私はマルマンのスパイラルノートA6くらいの使ってます。色々書いて、スマホの横、開きタイプのスマホカバーの上に置いてメモ帳アプリに見ながら書きます。

ほぼにち手帳使ってるので
日々の雑事や備忘録ついでにネタや妄想もメモしてます
仕事のことは一切書かないのでスペースには余裕あるし、暮らしのほぼ全てを一冊に詰め込めるので後で読み返してもたのしい

私は自分があった時用にジャンル関係なく使えるネタ帳をノート三冊（種類はバラバラ）にまとめてます。後、ウェブ上でそれぞれのジャンルのネタ帳を、長編、短編と分けて作ってますね。

トレロに項目作って書き溜めてる。スマホがない時は手に書いて後々移してる(笑)

同じく長編書くようになってGoogleのスプレットシート使い倒してます。
種類ごとにまとめたりソートしたりするの楽。そのまま別シートで並べ替えてプロットにもしてます。
好きな端末から編集できるのと画像とかもまあ挿入できるし、参考URLとかも一緒にメモしてそのままリンク飛べるので結構いいです。