・そもそも間違えやすい
私も以前、ファンアートで漢字を間違えたことがあります。
例）
誤）菊池
正）菊地
自分でも間違えやすいから注意が必要と思っていて「菊地」を選んだつもりだったのに、変換をミスって「菊池」になっていました。
変換でも並んでいたり、何度か打ってる内に上下が逆転していたりで間違えやすかったりします。
　
　
・そもそも伝わればいい
斎藤でも齊藤でも斉藤でも、漢字が違ったとしても伝わりますよね。
また異字体は基本的に漢字の形は違ったとしても意味は同じです。
であれば、意味は伝わるわけです。

実際の人名でも、戸籍上は異字体（旧字・古字）であったとしても実生活では分かりやすいように常用漢字で生活している人も多くいます。

何かしらの「こだわり」でもない限りは異字体であっても気にしません。
私も実名は病院などで度々間違われますが、いちいち相手にしてたら自分も相手も疲れるだけなので気にしないことにしています。
例）
誤）伊藤
正）伊東
　
　
・そもそも変換で出ない
異字体に多く見られるのは、そもそもJISの文字変換で出てこない、出てきにくいことです。

そもそも間違われやすい漢字をわざわざ使う意味は？と聞かれて「なんかカッコいいから」でしかないなら厨二臭いなぁなんて正直思います。
実際そういうのに惹かれる気持ちは創作してる身としてはよく分かるし、自キャラにわざと難しい漢字を充てがうこともよくします。
しかしほぼそれとセットで「名前間違われるネタ」も一緒に生まれるもんだと思っています。

「筆」という漢字の異字体で「笔」という字があります。
毛を集めて作った筆だから 「笔」。
良い漢字じゃありませんか！
けど、まぁたいてい「筆」になりますよね。

実際の人名の異字体はJIS変換でも多くが出てくるようにはなっていますが、それでも変換しにくい漢字というのはあります。
それをわざわざ探すほどのこだわりを当人以外は存外持ち合わせないものです。
　
　
・そもそも誤解を生む文字を使うのが悪い
私も一時期HNを間違われることがありました。
_（半角アンダースコア）を２つ続けて使っていたのですが
それを＿（全角アンダースコア）と間違われることがありました。
例）
誤）hash__tag
正）hash＿tag
パッと見て違いが分かりますか？
もちろん見てるデバイスやフォントなどにも依るんでしょうが、正直分からないと思います。
自分もあぁ間違われてるなーと思いつつ、そもそも間違えやすい記号や文字をわざわざHNにしてるのも悪いよなぁ、と大人しく変えることにしました。

人名もハンドルネームも、「分かりやすさ」も大事だと思っています。
なんでわざわざその字を使うの、なんでそんな読ませ方なの、って思う名前の人はたくさんいますよね。
DQNネームとかまさにそうですしが…

知り合いに「O」という方がいます。
「ゼロ…さんですか…？」
「ってみんな読むんですよね。オーって言います。」

「ゼロ」さん ではなく「オー」さんでした。
数字のゼロではなくアルファベットのオーだから。
こんなん間違えるでしょ、っていう意地悪な悪印象しか正直受けませんでした。

有名所だと「竜騎士07」さんとかもその類だと思ってます。
書き文字であれば間違えることはあまりないですが、これで「ドラグーンレナ」と読ませるのはなかなか難儀で、実際何度も間違われるから「りゅうきしぜろなな」で良いよ、ということになってるみたいです。
　
　
・けど、一度間違えれば覚えてもらえる
攻殻機動隊という作品に「合田一人」という名前のキャラがいます。
「あいだひとり」と読んでしまいそうですが「ごうだかずんど」という名前です。
曰く
「なかなかちゃんと読んで頂ける人に出会わない。
　さして変わった名前とも思わないんですがね。
　ですが今となってはなかなか良い名前だと思ってる。
　なんせ一度教えればたいてい相手の記憶には残りますからね。
　特にこの顔とセットで。」
と、初対面の人には必ず間違われるが、一度読み方を教えれば必ず覚えられるのが「間違われやすい名前のメリット」でもあります。
トピ主さんも名前を間違われて、何度も何度も同じことを異なる人に言うのにイライラするかも知れませんが、デメリットよりもメリットに重きを置くと気が楽になると思いました。

一ノ瀬と一之瀬が間違いやすいのは、二次元キャラの苗字として両方ありがちだからじゃないでしょうか。例えば好きな作品が二つあって、一つに一之瀬タケシ、もう一方には一ノ瀬カズキがいたとしたら、ごっちゃになることもあるかもしれません。
ペンネームに関しても、今まで出会った人の大体が「凛」さんとか「花凛」さんとかで、「凜」さんに出会ったのは初めてだったりすると、先入観で前者の漢字だと思い込んでしまうケースもあります。

とはいえ一之瀬(一ノ瀬)も凜(凛)も両方仮名なので、実際にはもっとアニメキャラやHNに使われにくい苗字(漢字)なら的外れかもしれません。

他には、職業上他人の名前をたくさん正確に覚えないといけない人は、娯楽の世界でまで頑張って名前を完璧に覚え切るキャパシティがないのかもしれません。
リアルの友人によくキャラの名前や漢字を間違える人がいるのですが、その人は教師で受け持ちのクラスの子の名前に関してはしっかり覚えているようでした。
本人に直接聞いたわけではないので私の勝手な推測にすぎませんが、結構人の名前を覚えるのって骨が折れるので、何十人の生徒の名前をきっちり覚えるのにエネルギーを使い果たしているのかもと思いました。

ちなみに私はキャラ名や他の人のHNを書くときは何度も間違っていないか確認してます。確認を怠ると好きなキャラでも結構間違えてしまうことがあるんですよね。田嶋を田島と書いてしまうとか。
でもそこまでやる人はそんなにいないんじゃないかなと思います。私はキャラに対して軽薄だと思われたくないのでいちいちチェックしてますが、これも自己満足としてやりたくてやってるだけなので。

キャラの名前ならともかく、HNの漢字までに気にしないかな。というのが率直な意見です。

元々トピ主さんと同じように誤記しやすい漢字を使用していたのですが、まあ間違えられる。
でも変換で一発目に出てこないですし、出てきたとしても見分けはほぼつかないので仕方ないんです。
そう思って私はひらがなにしました。
読み間違えることは無いので此方は傷つくことも相手が気を付けることもないです。
漢字に拘りがあるのであれば別ですが、そうでもないのであればご検討ください。

その延長線上で難しい漢字の方は全部ひらがなで呼んでしまっていますが、やっぱ嫌ですかね…。（質問に質問で返す形になりすみません）