自分の場合、起承転結と山場を考える時点でキャラから着想を得てるからな……。解釈は先にある物だし、展開と食い違う場合は展開を折るよ。二次創作だし。

一次創作だったならストーリーを基盤にしてキャラ付けしてくのも有りだけど、それでも行動理由が一貫してないのは困るね。疲れて完成させられないなら、まずは短編で練習してみたら？

折角練りに錬った長編でも、キャラがらしくない、共感できない、だと評価を貰い難いとおもう。
長いお話考えるのが好きって特性は後で必ず役に立つだろうから、一旦「キャラを一貫して動かす力」を長編に見合うところまで育てると思って短編も書いた方がいいんじゃないかな。ある程度は慣れもあるし。

解釈を濃いめに詰めるなら原作沿いの各話行間埋めがやりやすいから、大抵のジャンルではまずそれをする
行間埋めだと前後の原作話から感じた自分の考えみたいなのが自然に取り入れやすい（あのときAがこう言ったのはこう思ったからだ、それを聞いてたBはあとからこう言ったんじゃないか、その理由はBにとってAがただのライバルではなく無意識に惹かれている憧れの存在だからだ、みたいな）
あとは過去設定の長めの話とかも大抵一度は創る
ひととおりそういう創作をすると、なんとなく自分の中での推しカプ観が定まるから、そうなるとSSなんかにもその要素が組みこみやすくなる
雨宿りする話に、BにとってAはライバル兼憧れの人だみたいな解釈を引っぱってきて展開させる感じ
そうすると、雨宿りするなら普通は雨に濡れないように待つけどABだと雨の中を学校まで競争しそうとか、そのときBはこう言いそうとか、解釈に基づくキャラ設定からセリフや展開に一貫性が出てくると思う
そうじゃなく雨宿りしながら雨音を聴くエモい話書きたいってのが先にあってそれ前提で書いてしまうと、自分の思うABの解釈とは違和感のある話ができちゃう気がする
収集がつかないのは自分の解釈の多様性を認めると解決するかも
Aは憧れの人という解釈で書いた話がいくつかあっても、新作では、実は逆でBこそAの憧れの人なんだみたいに変えてもいいし、単なる憧れの人ではなく理想を投影した存在でその理由はBの過去にあるみたいに発展させてもいい、みたいに自分のブレを許容したほうが書きやすい気がする
許容せずに憧れの人なんだという解釈は絶対としてしまうと、でも他の要素や解釈とうまく整合しなかったり要素が多すぎてまとまりが悪くなったりして収集つかなくなることもあると思う