SSってワンシーン程度の描写が多いから、シーンとシーンを繋げて１つの話にすればいい
短編も１日単位であることが多いから、それを繋げていく

3000字程度のSSだとほぼ1シーンだけじゃない？
SS1つだけで膨らましても限度あるし、下手したらただの冗長な文になりかねなさそうだけどな……
SS元にする場合は同じ世界軸のSSいくつか並べて増やして合間を肉付け、もしくは1つのSSの前後を新しく考えて付け加えるよ

お題SSを短編2〜3万字の短編にするなら元は1〜3つくらいのシーンだと思うのでまず分解。
その上でそれらを使えるように考慮して、ラストをどうするかイメージしながらプロットを新規に再構築する。
その際起承転結(あるいは三幕構成)でそれぞれ何文字くらいのエピソードを書くか想定しながらプロットを作成。
この段階でキャラがさらに必要なのか。あるいはイベント(どこかに行く、トラブルが起きるなど)のアイデア考えて補って行く。
あとは執筆しながら調整。
自分ならこんな感じで進めます。

1番簡単なのは

一緒の部屋でイチャイチャしながら2人で料理を作って食べるシーン3000字だとしたら

付き合った経緯、一緒に過ごそうと約束したやり取り、会うまでの心情描写、会った時の会話、共に過ごす時間、料理する時間、一緒に食べる描写、改めて幸せを感じる心情描写

みたいに、時間軸を引き伸ばすといいよ。ダラダラ冗長いらね。って人もいるけど初心者なら冗長でもOK
とにかく1日のうちの例えば昼から夕方のエピソードから、前日夜～翌日朝までとか時間軸を伸ばして全部書けば長い文章は書ける

自分はエピソードを追加してる
ワンドロワンライ用の話は場面切り取りなので、「深夜に一緒にアイス買いに行く」で終わるけど、短編として書くならアイス買いに行く前にいざこざ入れるし、アイス買ったあと公園で二人で食べながらいざこざについて振り返りさせる
そもそも元がSSなら話としての強度が弱いので、補強が必要だと思う

そもそもなんで長くしたいの？
SSや短編を何本か書いて短編集を出せば良くない？

SSで書いたワンシーンだけを起承転結に引き伸ばしても内容が薄くなるだけなので、例えばSSの内容を起として、残りの承転結を新たに作るようにする

文字数を増やすためのキャラの追加は悪手。
上で散々言われてるけど、エピソードを追加して、そのエピに必要なキャラだったら追加する、というか、追加せざるを得なくなる。

プロットを細分化する
なんらかの感情の動きがある場合、その動きの根拠や補足になるようなエピソードを追加する

例：嫉妬の感情が膨らんで喧嘩になってしまう
→複数のエピソードで嫉妬がじわじわと募っていくようにする

物語の構成って概念ない人は、ひたすら字数を稼いだり、描写を細分化すれば長編小説になると勘違いしがちよね

同じお題でもう一作SSを書いて合体させる

SSを元に何とか文字数を稼ごうとするんじゃなくて、SSを元にして、その先のストーリーを連想するのよ
SSってどっかの場面を切り取った話なわけでしょ？
2人の人生はそこで終わりじゃなくてずっと続いていく
SSに登場する2人はこれからどう過ごしていくかなとかどうやって仲を深めるかなって妄想して付け足してく
もしくはどうやってSSの状況にたどり着いたかを書き足していく
そこにカプ萌えらしい一貫性というかストーリーがあれば立派に小説になるよ
例えば2人がだんだん仲良くなっていくとか、だんだん分かりあっていくとか、そういうのがわかりやすくて書きやすいね

もう既出だけど、もともと短い話を膨らませるのって限界があるんだよ。そりゃ、無理やり前後を考えてくっつければ長くはできるけど、多分それをやって8000字が限度だってなっちゃったんだと思うんだけど。
それでも長くしたいなら、俯瞰してその話をエピソードの1つにして、別の他の話を足して長い話に持ってくことかな。
でも、自分的にはやりにくい方法だとも思う。長編書くときは長編の話になるような話をそもそも考えた方が早いと思うよ。急がば回れ。