どマイナージャンル、そこそこ人気ジャンル、どちらも経験あります。
どマイナーの時は格安印刷所で完売しても赤字確定というレベルでしたが、１冊も売れなくても精神ダメージはさておき金銭的にはまあいいやと思える赤字額で抑えるようにしていました。
そこそこ人気ジャンルでオフセット刷れるようになったら、完売した時にイベント参加費とか遠征費込みでトントンになるように装丁盛ったりノベルティつけたりして調整していました。
部数は、それこそ人によってスタンスが違うと思いますが、自分は欲しいと思ってくれる人に渡したいので多めにします。たいていは確実に捌けるであろう部数＋100部（オフセの最低単位）です。なので、結局いつも数十冊は余らせてるので完売してないから赤字、でも印刷費だけなら余裕で回収、みたいな塩梅です。