在庫を抱えたくないとの事なので50部でも良いのですが、その数字だとオンデマンド印刷になると存じます。折角の記念ですから、オンデマンドより綺麗な印刷になるオフセットでの発行にしてみてはいかがでしょうか？
大体100部から受け付けている所が多いので100部目安でしょうか……。

オンデマンドよりはお高くなりますが、例えば9月末までの入稿だったらカンビ(リーブル)さんでは半額フェアをやっていたり、その他の印刷所でも色々と割引をしている所がございますので調べてみてください。
正直その数字であれば300部くらいは刷っても大丈夫ではないかと思うのですが、トピ主さんの作風やフォロワーさん達の雰囲気もわからなくて初同人誌なのに万が一の事があった場合が怖いので、全然売れなくても財布へのダメージが最小で、売り切れた場合は赤字にならず再版も考えられる数字、と思うとやはり100部ですね。

50部刷って50部再販した者です。
私も再録本でしたよ！そして私もコメントやいいねはさほど貰っていませんでした！

通販しますね〜ってツイートしても全然反応もなく在庫絶対抱えるなって思ってたらすぐ50部なくなったので、購入した方はどこから出てきたんだ…？って不思議でした。

トピ主さんは余裕で100部以上でそうな気がしますが、念のためGoogleフォームのアンケートを取ってみてはいかがですか？アンケート数は当てにならないんですが（笑）一応、どれくらいの人が押してくれたのか目安としてざっと把握しておく感じでやってみるのもいいかな、と。
あとアンケートフォームに、記述式のコメント欄を置いておいて、そこにコメントくださった方の数も把握してます。
コメントをわざわざ書き込んでくださるってことは、購入してくれる気持ちが強いんだな…と思って（あんまり真に受けないようにしますが）

アンケートは本当に当てにならないので、ざっと見るに限りますが、ご参考までに！

トピ主さんは同人誌を発行するのは初めてでしょうか？
それなら100〜300部ぐらいがいいかなと思います。
これぐらいなら完売したら再販すればいいし余ってもそこまでの量にはなりません。
同人誌を何回も出してる方ならもっと多めに刷ってもいいと思いますが、初めてなら少なめで様子見するのもありではないでしょうか。
初めてで大量に刷って余っても大変なので。
イベント会場で瞬殺だとせっかく買いに来てくれた方に行き渡らない可能性がありますが、通販なら完売しても再販のアナウンスをすぐ出せばいいです。

トピ主さんの同人誌が売れるかどうかはこの文だけでは判断出来ませんが、50部と100部だとあまり印刷費も変わらないので50部丸々余ってもいいやで100部刷ってもいいと思いますよ。