>腐やshipper
これについては
男性と男性の恋愛を指す言葉じゃなくて
男性と男性の恋愛←を見て喜ぶ人を指す言葉なので同性愛への差別には当たらないんじゃないかなと思います。そしてこれを記載するかどうかの有効性はどんなふうに活動しているかによります。
例えば鍵垢でプロフが「20↑腐」しか書かない場合（nmやhnnmにありがち）、詳細なプロフは鍵付きのベッターに書いてあることが多いです。逆にいうと鍵のある場所にしか詳細が書けないので腐までは書いてあったほうがそういうアカウントだと他者にわかりやすいから有効です。注意喚起よりは、仲間内とかこれからフォローしたい人向けに何用か教えるためにつけてるってことですね。
あとshipperって海外だとそういう意味で使ってる人あんまりいないって聞いたことあります（和製英語化してる？）。探してもいないのはそのせいかもしれないです。

> 同性愛、男×男
これは上で別コメの方も書いてますが書きたいなら「BL好き」という表記で良いと思いますし、少なくとも作品みて知ってるならカプ名見るだけでBLだとわかるからなくても良いとは思います。
また、上の通り腐と書いておいたほうが有効な場合にはもう一度書く必要はないかなと思います。

たとえジャンル公式で同性愛関係のあるキャラがいたとしても、トピ主さんの取り扱いカプは公式カプではないんですよね……？
ならBLタグつけるか腐タグつけておいてほしい…と私は思います。
ファンアート(非公式の恋愛関係描写や妄想が入ってないもの)は見たいけど、やおい絵は見たくない…というファンの人が自衛しようとしても、タグついてないなら自衛しようがないですし。
そもそも日本のオタクコミュニティでの話なんですよね？海外サイトでのことなら現地のお作法に合わせればよいかと思います。でも日本語・日本のオタクコミュニティでの話なんですよね…？
なら日本語サイト・日本のサイトのローカルルールに従って棲み分けをしていくのが1番無難かと思いますけど…

腐タグやBLタグをつけたり、同性愛であることを注意喚起するのは、
性的少数者への差別でもないし、なんなら表現の自由を弾圧するためでもなんでもなく「これは公式の関係性ではなく、いちファンの妄想の産物ですよ！(公式の関係性以外を妄想しているのが苦手な人は気をつけてね！)」というワンクッション目的だったり、同じもの(やおい、BL)が好きな人が辿り着きやすくするためにつけるものだと思ってますけどね。
弾圧がどうとか、差別がどうとかではないでしょうよ。棲み分けです。
トピ主さんも成人向け作品はポイピクに置いたり、パスワードつけたりとワンクッション置いてるんですよね？
表現の自由だから〜と成人向け絵もモロだしにしたり、海外勢は無修正の成人向け絵を載せてるのに日本人絵師は修正をしなくちゃいけないなんて！とかいって、海外のサークルがこうだから私たちもこうするべきじゃない？って思いますか？
そのままストレートになんでもかんでも海外オタクのやり方や思想を取り入れちゃうのは正直褒められた行いではないと思ってしまいますけどね。(あくまでも私はですが…)

腐だの百合だのという隠語みたいな言葉よりもBLGLの方がまだ一般的には意味が通じるのでそちらを使った方がこれから先いいかなと思います。
以前『百合 イラスト』などで画像検索したらGLイラストが出てくるって、ちょっと問題になってましたし。
そして怒られると思うんですが、昔はノンケの私ごときが2次元のBLGLを楽しんで現実のセクマイ様ごめんなさいとか思ってましたが、セクマイ様のノンケ女への見下しっぷりを散々見てしまったので、もうそんな気は起きません。もちろんまともな方もいますが。
真面目で自己肯定感が低い優しい女性ほど、セクマイ様の奴隷になりやすいのでセクマイ界隈とは距離を置いた方がいいです。

その辺色々議論があって難しいと思っています。「同性愛だからではなく、非公式カプだから住み分けを推奨しているだけ」と言いつつ非公式男女カプが(腐以外の人間からは)槍玉に挙げられることは少ない現状を見ると「非公式だから」は建前で実際は同性愛嫌悪が根底にあるのでは？と思いますし、一方でBLGLは現実に苦しむ同性愛者の姿を歪めて娯楽として消費しているだけのものだという批判もあり、それも確かに否定できない部分があります。

「腐女子表記をするべきか否か」だけを考えるなら「周りに合わせておけばどっちでも問題ない」で話が終わるのですが、同性愛に対する偏見や差別を絡めると論点がブレやすく、不毛な議論で終わる印象です。とりあえず表記は周りに合わせて、自分の中でじっくり向き合うのがいいかもしれません。

性の問題って難しいですよね。でも腐やBLは実際の同性愛者への差別用語だとは思いません、少なくともその言葉を日常的に使っている自分からすれば。
強いて言えば品質表示のようなものだと思ってます。そばアレルギーの人が、そば粉が入っていると知らずにそば粉入りの何らかの食品を食べたら命にかかわります。同人趣味はそこまでのものではありませんが、同人の知識や耐性のない人が思いがけずその世界を知ったら、自分の価値観を崩されたと不快に感じたり、正義感（異性愛こそが正しいという考え）を振りかざしてきて喧嘩になるかもしれません。同人に理解がある人もない人も心にダメージを負わないように、自分の趣向はこういった要素が含まれていますよ、知らない人は興味本意で見に来ないでね、という単なる「表示」、「看板」として掲げているものだと思います。
でもぶっちゃけBLと言いつつやたら受けが女性的で、もはやそれは夢なのでは？って作品もたくさんありますし…。純粋な意味での「同性愛」と向き合っている腐女子って、案外少ないのかもしれないなと思いました。

読んでて同じジャンルかも？と思ってしまった
海外作品で、公式が人種やジェンダーなどの世界問題をかなり意識した作品で、同性恋愛も公式内で行われるってとこが。

私は「腐向け」「腐」とつけるのはやめましたね。同性愛描写＝腐ってる。って表示が誤解を招きそうなので。
公式同性カップルの二次はかなり人気で私もたまに描きますが、いくらカプが公式でも二次創作の内容自体は「捏造」なので何もつけないのもおかしいですよね...
なので自分は、カプ名＋BL（GL）で活動しています。

ジャンルが本当に同じかどうかわからないですが、自ジャンルは公式が二次創作に寛容なためカプ名しかつけてない人もたくさんいます。（カプ名が必ずカップルな訳じゃなくコンビ名もかねてるから超ゆるゆる）