作業スピードは人によるので、まず1週間くらいガチで作業してみてペースを計算してみてはいかがでしょう。
入稿に手間取ったり、あとで修正する必要がでたり、風邪を引く等の突発的なトラブルに見舞われることがあることも考慮して、初めての制作であればページ数による単純計算×1.3～5くらいのバッファを取っておいたほうがいいと思います。
もし残念ながら落選したら、次回のコミケなり他のインベント(コミティアなど)に出れば良いのです
がんばってください。