・深夜にグライダーで孤島入り、電気系統にトラブルを起こして警備がそっちにかかってる間に突破
・ウェットスーツで潜って孤島入り、排水管とか排水溝から内部に侵入
・機材はとりあえず電気系統トラブルか潜入後にメインルーム的なところを制圧、基本は二人行動
みたいな感じでどうでしょう。

潜水艇とかで海中から島へこっそり上陸とかは？
(M○Sやその元ネタで観た)
ドンパチしたいのか、スニーキングミッションしたいのかで変わってきますね！

SFなら光学迷彩で侵入とか…？
あとは、建物との交通手段の職員に成りすまして侵入するというのも手かも。

某ゲームだと壁を昇って侵入して無音で一人ずつ警備員を絞めていきますね。想像してたら目だけで会話する推しCPが見たくなってきた…。

警備員の格好をして紛れ込んで侵入

荷物に紛れるなら、コンテナに手品的な空間があって二人で詰まっているとか。
一人が業者に変装して、もう一人は研究用の動物死体の中。警備が検品で刺したりする。

出入りの弁当業者やら納品業者に紛れて侵入するとか？
海の上に孤立した状態の建造物・オフィスなら外からお弁当の宅配業者呼ぶか、それか社食があるか……って感じだと思うので、
それ関係の納品業者は絶対毎日出入りしてるしてるはず→ならそれに紛れて中に入れるのでは？という考えです

他の組織とか警察のガサ入れの情報を流して警備が固まってる好きに裏側から侵入！！！！
空からダイナミックお邪魔します！！！！！
正面で爆発を起こして注意が逸れた隙に側面から侵入！！！！！！

ハッキングでシステムダウンさせる
幹部を洗脳
警備員か幹部の身内を人質に取る
内部に裏切り者を準備する
放射能か中性子で建物の中の人間に被害を与え後から防護服着てお邪魔します
超大多数の人間がその建物に群がる様な情報を流して誘導し人海戦術の肉の盾でその隙に侵入

トピ主です。みなさんありがとうございます！なんだこれすごい、妄想がめっちゃ捗る！！！思いつかないってもにょってたのが、めちゃくちゃ楽しい…！
みなさんのコメント拝見して、見せようによってはめちゃくちゃでかい見せ場になりそうとわかってわくわくしてます。野郎どもド派手にいくぜ！！ありがとうございます！
締めないので、このあともなにか思いつきましたら是非お願いします

荷物搬入のトラックの列（警備厳重とのことなので検問があると想定）ができているところで、警備員などの関係者に扮してトラックのドアをノック。
運転手が窓を下ろすので、運転手の顔に催眠スプレーを吹き付けて、昏倒させる。
素早く扉を開けてトラックに乗り込み、運転手になりすまし、難なく侵入。伸びてる運転手は邪魔なのでトラックの荷台に押し込む。