人間キャラのデザインの設定資料のパソコンでの保存方法

同人と言えるか微妙ですが自作イラストを使ったフリーゲームを作っています。

いつもは立ち絵などをまず初めに描いてから、それを別ウインドウに開いて、見たり、
画像ソフトに読み込んでレイヤーに張り付けて参考にしていましたが、
次回作から前・後ろ・横・細かいメモなどを描いた設定資料のような画像をあらかじめ作ろうと思います。

クリップスタジオを使いたいのですが、そういう資料はPNG形式とかで保存するべきかclip形式にするべきかどうか迷っています。

●自分の知識で思いつくメリットとデメリットは
・clip形式はレイヤーやテキストが記録できる半面、レイヤーがたくさんあるとほかの画像ファイルに張り付けるのがめんどう・見たいだけなのに間違って描いてしまう可能性がある。

・PNG形式はその逆でレイヤーなどがない

・clip形式とPNG形式両方を保存しておくと編集のたびにPNGも更新しなければならない。

といったところです。

また、設定資料はキャラごとに保存するのか、キャラごとにレイヤーとかを作り、一つのclipファイルにまとめるのか、それとも大きめの画像にまとめるのかも悩んでいます。

皆さんはどうしていますか？
そもそも画像ファイルで作る以外の方法があるんでしょうか？
ある程度決められたやり方やノウハウのようなものがあるのならそれも知りたいです

（自分は、絵もPCもゲーム作りも、あまり詳しくないかもしれません。）