■やろうとしている一次創作で判断する
次のどちらかに当てはまるなら、アカウントを分けた方が良いかと思います。
①やろうとしている一次創作のメインターゲットが未成年である場合
②やろうとしている一次創作が尖っていない作品である場合
③やろうとしている一次創作が男性もターゲットである場合
　
　
①やろうとしている一次創作のメインターゲットが未成年である場合
中高生や若い子をメインターゲットに据えた作品、またファミリー向け作品を作ろうとしているのであれば、
いくら作家アカウントとは言え健全作品と成人向け作品を混ぜて置かない方が良いかな、と思います。

もし、やろうとしている一次創作のターゲットがちょっと大人向けの全年齢向けなのであれば、
別に成人向け作品と並んでいても問題はないかな、と。
　
　
②やろうとしている一次創作が尖っていない作品である場合
一次創作は、育っていない内は作家についたファンに頼る形になることが多いです。
作品として尖った内容であるなら、割と早い段階での口コミなどでファンも付きやすいため
モチベも保ちつつ一次創作活動できると思います。
　　
　
ただ内容的に丸い万人受け的な内容であったりするならば、作品にファンが付くまでに時間を要したりします。
であるならば、自身の二次創作活動で付いたファンの人にも読んでもらえるように、同じアカウントで運用した方が良かったりするかも知れません。
　
　
③やろうとしている一次創作が男性もターゲットである場合
男性はBL気嫌いする人が多いですから、そういう作品を描こうと思っているなら分けても良い気がします。
最近はそういうのにも理解を示す男性ユーザーも多いですが、本能的な問題なのでどうしても抵抗感は拭えないかと。
特に成人男性だと抵抗感ある人多いですし、未成年男性だと衝撃やショックを受ける人もいますから。
　　　　
　　
■更新頻度によって判断する
トピ主さんの作品投稿頻度がどのくらいなのか分かりませんが、
　TwitterアカウントA（二次創作成人向けメイン、一次創作全年齢サブ）
　pixivアカウントa(二次創作・成人向け)
　pixivアカウントb(一次創作・全年齢)
というような運用とか良いんじゃないかと思います。
Twitterの方が口コミや拡散性が高いため、Twitterの方を統合運用し、pixivの方で分ける、など。

逆に
　TwitterアカウントA（二次創作成人向け）
　TwitterアカウントB（一次創作全年齢）
　pixivアカウントa(二次創作・成人向け、一次創作・全年齢)
と分けるのもありかと。
Twitterの方がアカウントの切り替えが楽だからですね。

個人的な意見を言わせてもらうなら、一緒のアカウントでやった方が見てくれる人は初動から一定数いるのはモチベにも繋がりやすくていいかな、と。
ただ、アカウントを分けてTwitterアカウントBで投稿した後にTwitterアカウントAで引用RTして「こういうのも描いてます」と自分で作品紹介していくスタンスが取れるなら、アカウント分けてもそれなりに見てくれる人が確保できていいかな、と。

結局、トピ主さんの作品傾向やターゲット、SNSのスタンスで判断されるしかないのかな、と。
私個人の一意見として、判断の参考にしてみてください。