私は都内住みにもかかわらず同じ気持ちです。
出したいと思って長い間尻込みしてる私なんかより
ちゃんと出しているのだから素晴らしいと思います。

残っても怖くない在庫量を意識した部数にすれば良いのではと思います。

在庫が残りすぎるのは問題ですが、ある程度残しておくことで、次のイベントでも頒布できるメリットはあります。
新しく自分のサークルを訪れた人にとっては、既刊もまた自己紹介の材料だったりしますし。

とは言え、遠征費云々でサークルと黒字運用したいという思いも分からなくないです。
毎回遠出するのもシンドイならば、DL販売や委託という手段を考えてみても良いのではないでしょうか。