私も色塗り苦手です。
なのでとりあえずTwitterで素敵な絵描きさんを見つけたらその方の塗りを見たり、講座系のRTが回ってきたら真似したりしてます。
あとはもうひたすら試行錯誤を重ねてます。
私も厚塗りが好きなのですが、自分的に扱いやすくいい感じに塗れるブラシを見つけたのでそれを使って誤魔化し誤魔化し塗ってます。
私の場合はいろんな方がおすすめしてるブラシも片っ端から試しましたが自分には合わず、理想の塗りにはならなかったのでまずは自分に合うブラシを探してみるのもいいかもしれません。
お気に入りのブラシを見つけてからはそこそこ塗りも綺麗になった気がしていて、楽しいです。
線画の色についてはいろんな絵描きさんの絵を見て、どういう風な色にしたら見栄えがいいかを研究して真似てます。
線画レイヤーにクリッピングして違う色を重ね、場所によってエアブラシを使ったり、範囲選択で塗りつぶしたりしてます。

色塗りはブラシと色のチョイス、全体のバランスが基本だと思ってます。
　
　
ブラシはプロが「これ使ってるよ」とかを紹介してたりするので、同じものを使ってみる。
ブラシによってはテクスチャが含まれていたり、質感を再現するためにテクスチャを貼ったほうが手軽で良かったりもします。
そういうのも含めてブラシやテクスチャなどの素材を探す、使ってみるのは楽しいしオススメです。
葉っぱを塗るための葉っぱブラシとか、木の幹を塗るときは髪ブラシとかを自分はよく使っています。
　
　
色のチョイスは完成絵と色見本を一緒に載せてる絵描きさんとかの絵を参考にしたり、真似したい色味の絵から色をスポイトして参考にしたり、そのまま塗ったりしながら自分好みのカラーパレットを作っていく。
クリスタはソフト内だけでなく、ソフト外のブラウザなどから色をスポイトする機能があったりします。
カラーパレットはクリスタ内の機能だけでなく、それこそ画像そのものにパレットしていくのも手です。
配色見本になるハウツー本などを電子書籍で購入し、それをスポイトしながら使うなども効果的です。
また厚塗りなどされる場合は、本物の絵の具のようにキャンパスの空きで色を混ぜながら使うのも楽しいです。

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全体のバランスは、出来上がった後に白黒にすることで「明暗」のバランスを見たりするのも手です。
白黒で見て、描いてあるものの境目が分かりにくかったら、そこにハイライトを入れたりガッツリ影を落としたりして差をつけることでメリハリのある絵になったりします。
また最後の仕上げ加工とかフィルターを通すことで整えたり、一味違う出来になったりもします。
トピ主さんはジブリ系が好きだということなので、このへんはあまり参考にはならないかも知れませんが…

トピ主さんの使用ソフト、画材選択が何かわからないので推測ですが、ジブリ風がお好き、厚塗り好きということでそこに近づくには...という前提でお話します。
ネットでの講座をされてる作家さんは割とゲーム系、アニメ系で仕上げに光らせるの多いですよね。これお好きではないと思いますが、一度は手順どおりにやってみるのおすすめです。なぜかというと、絵が仕上がるまでにどういった手順を踏むか、というのを再現することで、ツールの使い方、効果などを覚えることができるからです。仕上がりは違っても、同じツールで違う作風の作品を作っているのが普通なので、道具の使い方を覚えるのに役立ちます。
あと厚塗りは割りと上級者向けなので、はじめは水彩風とかパステル風の作風の作家さんを参考にされてはいかがでしょうか。薄塗りレイヤーを何段階も重ねると重厚になりますし、テクスチャを使って風合いを出すことができます。線画もブラシの選択でだいぶかわります。いろいろ試してみてください。