・作家本人の意向（「健康上の理由で描けない、描きたくない」など）で更新ストップ
・人気が無かったため連載打ち切り
・掲載媒体の都合により更新ストップ（担当部署の縮小など）
・その他契約上のトラブルにより更新ストップ
パッと思いつく理由はこんな感じでしょうか。
いずれにしてもネガティブな理由である可能性が高いかなと…。

あと、あくまで私の知っている範囲ですが、同人である程度の実績があれば、商業デビュー自体は珍しいことではない気がします。
ただ、問題はデビューした後ですよね。どれだけ同人で大人気でも、商業でも人気を得られる人、また人気を維持できる人はほんの僅かです。
私の大好きな大手同人作家さん数名も商業デビューしましたが、デビュー作以降は商業で描くことはほぼ無く、再び同人活動に注力されるようになりました。
商業のハードルはこれほど高いのか…と感じました。