はじめに、煽りとかじゃなく傷つける意図もないです。長文なので気が向いたら読んでね。

トピ文だけ見たらASDなどによくある特性の一つなんだけど、もしかして国語の読解問題も苦手だったりする？反対に数字や絵図・写真のある情報の理解が早い、とかもないですか？

◾️比喩表現や例え話など曖昧な表現を理解するのが苦手。言葉を文字通りに受け取ってしまい勘違いや誤解が生じやすい。

◾️言葉以外の表情やジェスチャー、身振りなどを理解するのが苦手。非言語的情報から相手の気持ちを読み取るのが難しく、コミュニケーションがスムーズにいかないことがある。小説における間接的な感情表現なども理解しにくい。

◾️物事を良いか悪いか、正しいか間違っているかなどの2つの極端なカテゴリーに分けて考えがち。読解や記述問題で表現や文脈を理解するのが難しい、抽象的概念を理解するのが苦手、教科書や問題集の解説にも納得がいかない場合がある。

こういう傾向が強かったら、確かに小説を読解し切れていない部分があるのかもしれないですね。
小説は読者それぞれが自由に解釈して楽しんでいいと思うけど、単純な読解力を上げたいということなら他コメの通り、とにかくパターン学習の積み重ねだと思う。

小説の表現しかり、対人コミュニケーションしかり、ある程度お決まりの型ってものがあるんだよね。トピ文の「相手を危険に晒したくないため、あえて冷たい言葉で突き放し着いて来ないように仕向けた」みたいなのは典型的な例ですね。
幼少期から読書量が多い人、人と多く関わる人はこれらの無数のパターンに触れていて、それが無意識に蓄積されてるから「あっ、これは相手を思ってのあえての突き放し！」とか「内心自信が無いのを隠したがってて無意識に強気に振る舞いがちな奴、きたわね」ってすぐわかるようになる。

そこにオタク解釈を加えると、「めちゃくちゃ大切に思ってるじゃん…愛じゃん…」とか「こいつの弱さを包み込めるのはAだけABこそ至高」となるんだよね笑

自分自身の考えは一旦置いておいて、「こういう表現の場合はこういう意図のケースが多いのか」という視点で沢山パターンを覚えていくと読解力上がるよ。
文章だけだと想像しづらい場合は、沢山挿絵のある小説や漫画なら理解しやすいって人も多いから入門媒体も吟味してみて。
「ASD 読解力向上」などで調べるともっと専門的な情報が出てくるから、合う方法が見つかるかも。

決してトピ主さんはASDだね！と言いたいわけじゃないです。似た傾向を持ってたら役立つ情報がまとまってるよってだけだから、参考にならなかったらスルーしてね。
あとトピ主さんの感受性は個性だから、今一般論と合ってなくても大切にして欲しい。一般論プラス独自の感性も持ってたらきっと素敵な表現ができるようになるよ。

AはBの肩に手を置き、ぶっきらぼうに言った。
「君では足手纏いです」

↑この文の前の展開と後の展開で解釈って変わってくるから、もしもこの一文だけしか見ずに判断してるなら、トピ文にある通り文字通りにしか読めてないんだろうね。

例えば

既に何人もの人間がコロされる事件が起こっていて、その事件を解決するために意気込む刑事Bとコロされている人間の共通項を発見した刑事Bの上司Aの話が前文にあったとしたら

AはBの肩に手を置き、ぶっきらぼうに言った。
「君では足手纏いです」

↑この文はコロされる共通項のある刑事BをAが守ろうとしてる解釈になるのが自然だと思う。
けど、前文が全く違って、普段からお調子者のBを疎ましく思っていて、何かある度にしゃしゃり出てくるBと、いつもBのやらかしをフォローするAという話が書いてあったら、いい加減Aがうんざりして言ったという解釈になると思う

後の文でも同じことが言えて、のちの展開で「実は……」っていう事がたくさんあるから、セリフの一文読む度に解析するのをやめて、前後の展開に注視した方が、あとから読み返した時にセリフひとつひとつの意図が汲み取りやすくなると思うよ

映像・漫画作品のノベライズ読むといいよー。先に映像や漫画のほうをみてからがおすすめ。小説原作の映像化、じゃなくてノベライズ化、ね。
先に情報として表情なんかの表現を頭に入れて文字を追うと理解度が上がるし、繰り返せば法則みたいなものがわかってやりやすくなる。
私の身内に2人ほどトピ主と似たような感じの人がいるけどどちらもその形だと小説を読んでてもすんなり意見が合いやすかった。

本当は知識面のインプットを増やしてって言いたけどそもそもリンクしないんだよね、その情報と。
でも訓練（っていうとあれだけど）で結構向上できる能力ではあると思うから良ければ実践してみて。小説にも一定のルールがあるから。
日本語がそもそも行間を読む言語だから難しいけどね…楽しめるといいね！